RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490575.1

PTPRVP-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRVP, Length 953 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-202ENST00000490575 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRVP-202ENST00000490575 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRVP-202ENST00000490575 NHSQ6T4R5 1651 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRVP-202ENST00000490575 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRVP-202ENST00000490575 IL13P35225 146 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRVP-202ENST00000490575 BAG6P46379 1132 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRVP-202ENST00000490575 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRVP-202ENST00000490575 RREB1Q92766 1687 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRVP-202ENST00000490575 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.15■■□□□ 1.14
PTPRVP-202ENST00000490575 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PTPRVP-202ENST00000490575 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.14■■□□□ 1.14
PTPRVP-202ENST00000490575 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRVP-202ENST00000490575 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.14■■□□□ 1.13
PTPRVP-202ENST00000490575 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PTPRVP-202ENST00000490575 CYP27B1O15528 508 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRVP-202ENST00000490575 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRVP-202ENST00000490575 BTAF1O14981 1849 aa22.13■■□□□ 1.13
PTPRVP-202ENST00000490575 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRVP-202ENST00000490575 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRVP-202ENST00000490575 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRVP-202ENST00000490575 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRVP-202ENST00000490575 PROM2Q8N271 834 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRVP-202ENST00000490575 PPP2R1AP30153 589 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRVP-202ENST00000490575 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRVP-202ENST00000490575 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRVP-202ENST00000490575 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PTPRVP-202ENST00000490575 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRVP-202ENST00000490575 KDRP35968 1356 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRVP-202ENST00000490575 PLSCR1O15162 318 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRVP-202ENST00000490575 ITGB4P16144 1822 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRVP-202ENST00000490575 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRVP-202ENST00000490575 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRVP-202ENST00000490575 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRVP-202ENST00000490575 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRVP-202ENST00000490575 HMOX1P09601 288 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRVP-202ENST00000490575 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRVP-202ENST00000490575 PHKG2P15735 406 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRVP-202ENST00000490575 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRVP-202ENST00000490575 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
PTPRVP-202ENST00000490575 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PTPRVP-202ENST00000490575 TXNRD1Q16881 649 aa22■■□□□ 1.11
PTPRVP-202ENST00000490575 SPG7Q9UQ90 795 aa22■■□□□ 1.11
PTPRVP-202ENST00000490575 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPRVP-202ENST00000490575 LY75O60449 1722 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRVP-202ENST00000490575 KCNQ4P56696 695 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRVP-202ENST00000490575 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRVP-202ENST00000490575 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRVP-202ENST00000490575 PAPPAQ13219 1627 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRVP-202ENST00000490575 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRVP-202ENST00000490575 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPRVP-202ENST00000490575 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRVP-202ENST00000490575 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
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PTPRVP-202ENST00000490575 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRVP-202ENST00000490575 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRVP-202ENST00000490575 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRVP-202ENST00000490575 PIGBQ92521 554 aa21.93■■□□□ 1.1
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PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRVP-202ENST00000490575 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRVP-202ENST00000490575 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRVP-202ENST00000490575 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF827Q17R98 1081 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRVP-202ENST00000490575 CFAP53Q96M91 514 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRVP-202ENST00000490575 LGR6Q9HBX8 967 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRVP-202ENST00000490575 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRVP-202ENST00000490575 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRVP-202ENST00000490575 CASZ1Q86V15 1759 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRVP-202ENST00000490575 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRVP-202ENST00000490575 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRVP-202ENST00000490575 RALBP1Q15311 655 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRVP-202ENST00000490575 PALLDQ8WX93 1383 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRVP-202ENST00000490575 PRKAR2BP31323 418 aa21.85■■□□□ 1.09
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PTPRVP-202ENST00000490575 DCAF5Q96JK2 942 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRVP-202ENST00000490575 ATG3Q9NT62 314 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRVP-202ENST00000490575 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRVP-202ENST00000490575 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
PTPRVP-202ENST00000490575 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC15A2Q16348 729 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRVP-202ENST00000490575 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRVP-202ENST00000490575 AKT1S1Q96B36 256 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRVP-202ENST00000490575 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PTPRVP-202ENST00000490575 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRVP-202ENST00000490575 C5P01031 1676 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRVP-202ENST00000490575 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRVP-202ENST00000490575 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRVP-202ENST00000490575 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRVP-202ENST00000490575 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRVP-202ENST00000490575 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRVP-202ENST00000490575 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRVP-202ENST00000490575 NUDCQ9Y266 331 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRVP-202ENST00000490575 CABP4P57796 275 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRVP-202ENST00000490575 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRVP-202ENST00000490575 STK32BQ9NY57 414 aa21.79■■□□□ 1.08
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