RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488024.1

RASSF1-208, Transcript of Ras association domain family member 1, human

TSL 2

Gene RASSF1, Length 1,385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RASSF1-208	ENST00000488024	PPP2R1A	P30153	589 aa		33.41	■■■□□ 2.94
RASSF1-208	ENST00000488024	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
RASSF1-208	ENST00000488024	TRIM37	O94972	964 aa		33.36	■■■□□ 2.93
RASSF1-208	ENST00000488024	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		33.35	■■■□□ 2.93
RASSF1-208	ENST00000488024	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
RASSF1-208	ENST00000488024	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
RASSF1-208	ENST00000488024	KDR	P35968	1356 aa		33.34	■■■□□ 2.93
RASSF1-208	ENST00000488024	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
RASSF1-208	ENST00000488024	NHS	Q6T4R5	1651 aa		33.32	■■■□□ 2.92
RASSF1-208	ENST00000488024	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		33.3	■■■□□ 2.92
RASSF1-208	ENST00000488024	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	33.3	■■■□□ 2.92
RASSF1-208	ENST00000488024	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		33.29	■■■□□ 2.92
RASSF1-208	ENST00000488024	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		33.29	■■■□□ 2.92
RASSF1-208	ENST00000488024	RALBP1	Q15311	655 aa		33.29	■■■□□ 2.92
RASSF1-208	ENST00000488024	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		33.29	■■■□□ 2.92
RASSF1-208	ENST00000488024	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		33.28	■■■□□ 2.92
RASSF1-208	ENST00000488024	CFAP53	Q96M91	514 aa		33.28	■■■□□ 2.92
RASSF1-208	ENST00000488024	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		33.28	■■■□□ 2.92
RASSF1-208	ENST00000488024	BAG6	P46379	1132 aa		33.27	■■■□□ 2.92
RASSF1-208	ENST00000488024	CYP27B1	O15528	508 aa		33.26	■■■□□ 2.92
RASSF1-208	ENST00000488024	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.92
RASSF1-208	ENST00000488024	SPG7	Q9UQ90	795 aa		33.26	■■■□□ 2.92
RASSF1-208	ENST00000488024	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		33.25	■■■□□ 2.91
RASSF1-208	ENST00000488024	APBA3	O96018	575 aa		33.22	■■■□□ 2.91
RASSF1-208	ENST00000488024	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
RASSF1-208	ENST00000488024	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		33.22	■■■□□ 2.91
RASSF1-208	ENST00000488024	KCNQ2	O43526	872 aa		33.21	■■■□□ 2.91
RASSF1-208	ENST00000488024	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		33.21	■■■□□ 2.91
RASSF1-208	ENST00000488024	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		33.21	■■■□□ 2.91
RASSF1-208	ENST00000488024	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	33.21	■■■□□ 2.91
RASSF1-208	ENST00000488024	HMOX1	P09601	288 aa		33.2	■■■□□ 2.9
RASSF1-208	ENST00000488024	BTAF1	O14981	1849 aa		33.19	■■■□□ 2.9
RASSF1-208	ENST00000488024	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		33.19	■■■□□ 2.9
RASSF1-208	ENST00000488024	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
RASSF1-208	ENST00000488024	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
RASSF1-208	ENST00000488024	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		33.18	■■■□□ 2.9
RASSF1-208	ENST00000488024	RREB1	Q92766	1687 aa		33.17	■■■□□ 2.9
RASSF1-208	ENST00000488024	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		33.17	■■■□□ 2.9
RASSF1-208	ENST00000488024	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
RASSF1-208	ENST00000488024	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
RASSF1-208	ENST00000488024	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
RASSF1-208	ENST00000488024	PHKG2	P15735	406 aa		33.16	■■■□□ 2.9
RASSF1-208	ENST00000488024	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		33.16	■■■□□ 2.9
RASSF1-208	ENST00000488024	PLSCR1	O15162	318 aa		33.15	■■■□□ 2.9
RASSF1-208	ENST00000488024	NUDC	Q9Y266	331 aa		33.15	■■■□□ 2.9
RASSF1-208	ENST00000488024	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
RASSF1-208	ENST00000488024	ITGB4	P16144	1822 aa		33.13	■■■□□ 2.89
RASSF1-208	ENST00000488024	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
RASSF1-208	ENST00000488024	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		33.1	■■■□□ 2.89
RASSF1-208	ENST00000488024	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
RASSF1-208	ENST00000488024	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
RASSF1-208	ENST00000488024	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		33.08	■■■□□ 2.89
RASSF1-208	ENST00000488024	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
RASSF1-208	ENST00000488024	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	33.06	■■■□□ 2.88
RASSF1-208	ENST00000488024	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
RASSF1-208	ENST00000488024	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
RASSF1-208	ENST00000488024	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		33.03	■■■□□ 2.88
RASSF1-208	ENST00000488024	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
RASSF1-208	ENST00000488024	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		33.02	■■■□□ 2.88
RASSF1-208	ENST00000488024	LY75	O60449	1722 aa		33.02	■■■□□ 2.88
RASSF1-208	ENST00000488024	FCHSD2	O94868	740 aa		33.02	■■■□□ 2.88
RASSF1-208	ENST00000488024	PROM2	Q8N271	834 aa		33.02	■■■□□ 2.88
RASSF1-208	ENST00000488024	DCAF5	Q96JK2	942 aa		33.02	■■■□□ 2.88
RASSF1-208	ENST00000488024	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
RASSF1-208	ENST00000488024	PRKAR2B	P31323	418 aa		33.01	■■■□□ 2.88
RASSF1-208	ENST00000488024	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		33	■■■□□ 2.87
RASSF1-208	ENST00000488024	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		33	■■■□□ 2.87
RASSF1-208	ENST00000488024	TXNRD1	Q16881	649 aa		32.98	■■■□□ 2.87
RASSF1-208	ENST00000488024	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.98	■■■□□ 2.87
RASSF1-208	ENST00000488024	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		32.97	■■■□□ 2.87
RASSF1-208	ENST00000488024	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.96	■■■□□ 2.87
RASSF1-208	ENST00000488024	PIGB	Q92521	554 aa		32.96	■■■□□ 2.87
RASSF1-208	ENST00000488024	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		32.94	■■■□□ 2.86
RASSF1-208	ENST00000488024	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.94	■■■□□ 2.86
RASSF1-208	ENST00000488024	PAPPA	Q13219	1627 aa		32.91	■■■□□ 2.86
RASSF1-208	ENST00000488024	ANP32C	O43423	234 aa		32.9	■■■□□ 2.86
RASSF1-208	ENST00000488024	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		32.9	■■■□□ 2.86
RASSF1-208	ENST00000488024	MRC1	P22897	1456 aa		32.9	■■■□□ 2.86
RASSF1-208	ENST00000488024	MAP3K5	Q99683	1374 aa		32.89	■■■□□ 2.86
RASSF1-208	ENST00000488024	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.88	■■■□□ 2.85
RASSF1-208	ENST00000488024	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		32.88	■■■□□ 2.85
RASSF1-208	ENST00000488024	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.88	■■■□□ 2.85
RASSF1-208	ENST00000488024	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
RASSF1-208	ENST00000488024	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		32.87	■■■□□ 2.85
RASSF1-208	ENST00000488024	CABP4	P57796	275 aa		32.86	■■■□□ 2.85
RASSF1-208	ENST00000488024	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
RASSF1-208	ENST00000488024	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		32.85	■■■□□ 2.85
RASSF1-208	ENST00000488024	NBPF14	Q5TI25	921 aa		32.84	■■■□□ 2.85
RASSF1-208	ENST00000488024	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
RASSF1-208	ENST00000488024	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		32.84	■■■□□ 2.85
RASSF1-208	ENST00000488024	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.83	■■■□□ 2.85
RASSF1-208	ENST00000488024	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85
RASSF1-208	ENST00000488024	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.83	■■■□□ 2.85
RASSF1-208	ENST00000488024	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		32.83	■■■□□ 2.85
RASSF1-208	ENST00000488024	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.83	■■■□□ 2.85
RASSF1-208	ENST00000488024	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		32.82	■■■□□ 2.84
RASSF1-208	ENST00000488024	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
RASSF1-208	ENST00000488024	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
RASSF1-208	ENST00000488024	CCDC184	Q52MB2	194 aa		32.81	■■■□□ 2.84
RASSF1-208	ENST00000488024	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		32.81	■■■□□ 2.84

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