RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485896.5

C1orf35-205, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

TSL 2

Gene C1orf35, Length 1,429 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-205ENST00000485896 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.23■■■□□ 2.11
C1orf35-205ENST00000485896 APBA3O96018 575 aa28.23■■■□□ 2.11
C1orf35-205ENST00000485896 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.21■■■□□ 2.11
C1orf35-205ENST00000485896 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.19■■■□□ 2.1
C1orf35-205ENST00000485896 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.18■■■□□ 2.1
C1orf35-205ENST00000485896 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
C1orf35-205ENST00000485896 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
C1orf35-205ENST00000485896 KCNQ2O43526 872 aa28.16■■■□□ 2.1
C1orf35-205ENST00000485896 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
C1orf35-205ENST00000485896 NHSQ6T4R5 1651 aa28.16■■■□□ 2.1
C1orf35-205ENST00000485896 IL13P35225 146 aa28.15■■■□□ 2.1
C1orf35-205ENST00000485896 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.15■■■□□ 2.1
C1orf35-205ENST00000485896 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.14■■■□□ 2.1
C1orf35-205ENST00000485896 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.14■■■□□ 2.09
C1orf35-205ENST00000485896 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.14■■■□□ 2.09
C1orf35-205ENST00000485896 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.12■■■□□ 2.09
C1orf35-205ENST00000485896 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.12■■■□□ 2.09
C1orf35-205ENST00000485896 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.11■■■□□ 2.09
C1orf35-205ENST00000485896 CYP27B1O15528 508 aa28.09■■■□□ 2.09
C1orf35-205ENST00000485896 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.09■■■□□ 2.09
C1orf35-205ENST00000485896 SPG7Q9UQ90 795 aa28.09■■■□□ 2.09
C1orf35-205ENST00000485896 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.09■■■□□ 2.09
C1orf35-205ENST00000485896 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
C1orf35-205ENST00000485896 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
C1orf35-205ENST00000485896 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
C1orf35-205ENST00000485896 BTAF1O14981 1849 aa28.08■■■□□ 2.09
C1orf35-205ENST00000485896 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
C1orf35-205ENST00000485896 PPP2R1AP30153 589 aa28.08■■■□□ 2.09
C1orf35-205ENST00000485896 RREB1Q92766 1687 aa28.07■■■□□ 2.08
C1orf35-205ENST00000485896 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
C1orf35-205ENST00000485896 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
C1orf35-205ENST00000485896 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.05■■■□□ 2.08
C1orf35-205ENST00000485896 PLSCR1O15162 318 aa28.05■■■□□ 2.08
C1orf35-205ENST00000485896 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.05■■■□□ 2.08
C1orf35-205ENST00000485896 KDRP35968 1356 aa28.04■■■□□ 2.08
C1orf35-205ENST00000485896 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.04■■■□□ 2.08
C1orf35-205ENST00000485896 HMOX1P09601 288 aa28.03■■■□□ 2.08
C1orf35-205ENST00000485896 CFAP53Q96M91 514 aa28.02■■■□□ 2.08
C1orf35-205ENST00000485896 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.08
C1orf35-205ENST00000485896 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.01■■■□□ 2.07
C1orf35-205ENST00000485896 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.01■■■□□ 2.07
C1orf35-205ENST00000485896 PHKG2P15735 406 aa28■■■□□ 2.07
C1orf35-205ENST00000485896 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
C1orf35-205ENST00000485896 IFNL2Q8IZJ0 200 aa27.99■■■□□ 2.07
C1orf35-205ENST00000485896 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
C1orf35-205ENST00000485896 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
C1orf35-205ENST00000485896 AMOTQ4VCS5 1084 aa27.97■■■□□ 2.07
C1orf35-205ENST00000485896 PROM2Q8N271 834 aa27.97■■■□□ 2.07
C1orf35-205ENST00000485896 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
C1orf35-205ENST00000485896 TXNRD1Q16881 649 aa27.96■■■□□ 2.07
C1orf35-205ENST00000485896 ITGB4P16144 1822 aa27.95■■■□□ 2.06
C1orf35-205ENST00000485896 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.94■■■□□ 2.06
C1orf35-205ENST00000485896 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
C1orf35-205ENST00000485896 RALBP1Q15311 655 aa27.92■■■□□ 2.06
C1orf35-205ENST00000485896 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.91■■■□□ 2.06
C1orf35-205ENST00000485896 NBPF14Q5TI25 921 aa27.91■■■□□ 2.06
C1orf35-205ENST00000485896 NUDCQ9Y266 331 aa27.91■■■□□ 2.06
C1orf35-205ENST00000485896 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
C1orf35-205ENST00000485896 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
C1orf35-205ENST00000485896 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
C1orf35-205ENST00000485896 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
C1orf35-205ENST00000485896 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
C1orf35-205ENST00000485896 PIGBQ92521 554 aa27.87■■■□□ 2.05
C1orf35-205ENST00000485896 DCAF5Q96JK2 942 aa27.87■■■□□ 2.05
C1orf35-205ENST00000485896 TMOD3Q9NYL9 352 aa27.86■■■□□ 2.05
C1orf35-205ENST00000485896 LY75O60449 1722 aa27.86■■■□□ 2.05
C1orf35-205ENST00000485896 KCNQ4P56696 695 aa27.85■■■□□ 2.05
C1orf35-205ENST00000485896 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.85■■■□□ 2.05
C1orf35-205ENST00000485896 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
C1orf35-205ENST00000485896 PALLDQ8WX93 1383 aa27.84■■■□□ 2.05
C1orf35-205ENST00000485896 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
C1orf35-205ENST00000485896 RSPH6AQ9H0K4 717 aa27.84■■■□□ 2.05
C1orf35-205ENST00000485896 PRKAR2BP31323 418 aa27.83■■■□□ 2.05
C1orf35-205ENST00000485896 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.83■■■□□ 2.05
C1orf35-205ENST00000485896 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.82■■■□□ 2.04
C1orf35-205ENST00000485896 PAPPAQ13219 1627 aa27.81■■■□□ 2.04
C1orf35-205ENST00000485896 ERVV-2B6SEH9 535 aa27.81■■■□□ 2.04
C1orf35-205ENST00000485896 STK32BQ9NY57 414 aa27.81■■■□□ 2.04
C1orf35-205ENST00000485896 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
C1orf35-205ENST00000485896 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.8■■■□□ 2.04
C1orf35-205ENST00000485896 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
C1orf35-205ENST00000485896 ASAP1Q9ULH1 1129 aa27.79■■■□□ 2.04
C1orf35-205ENST00000485896 CABP4P57796 275 aa27.78■■■□□ 2.04
C1orf35-205ENST00000485896 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
C1orf35-205ENST00000485896 PHACTR3Q96KR7 559 aa27.78■■■□□ 2.04
C1orf35-205ENST00000485896 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
C1orf35-205ENST00000485896 FCHSD2O94868 740 aa27.76■■■□□ 2.04
C1orf35-205ENST00000485896 SLC15A2Q16348 729 aa27.76■■■□□ 2.04
C1orf35-205ENST00000485896 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.76■■■□□ 2.04
C1orf35-205ENST00000485896 ZNF827Q17R98 1081 aa27.75■■■□□ 2.03
C1orf35-205ENST00000485896 LGR6Q9HBX8 967 aa27.75■■■□□ 2.03
C1orf35-205ENST00000485896 ATG3Q9NT62 314 aa27.75■■■□□ 2.03
C1orf35-205ENST00000485896 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa27.74■■■□□ 2.03
C1orf35-205ENST00000485896 MAP3K5Q99683 1374 aa27.74■■■□□ 2.03
C1orf35-205ENST00000485896 RNMTO43148 476 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
C1orf35-205ENST00000485896 C5P01031 1676 aa27.72■■■□□ 2.03
C1orf35-205ENST00000485896 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
C1orf35-205ENST00000485896 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.7■■■□□ 2.03
C1orf35-205ENST00000485896 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.7■■■□□ 2.03
C1orf35-205ENST00000485896 SIK1P57059 783 aa27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms