RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
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GTF3C4-202ENST00000483873 NHSQ6T4R5 1651 aa35.86■■■■□ 3.33
GTF3C4-202ENST00000483873 PTF1AQ7RTS3 328 aa35.85■■■■□ 3.33
GTF3C4-202ENST00000483873 KAT6BQ8WYB5 2073 aa35.85■■■■□ 3.33
GTF3C4-202ENST00000483873 BAG6P46379 1132 aa35.83■■■■□ 3.33
GTF3C4-202ENST00000483873 DOT1LQ8TEK3 1739 aa35.83■■■■□ 3.33
GTF3C4-202ENST00000483873 PPP2R1AP30153 589 aa35.82■■■■□ 3.32
GTF3C4-202ENST00000483873 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
GTF3C4-202ENST00000483873 APBA3O96018 575 aa35.81■■■■□ 3.32
GTF3C4-202ENST00000483873 ACSBG1Q96GR2 724 aa35.81■■■■□ 3.32
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GTF3C4-202ENST00000483873 AEBP1Q8IUX7 1158 aa35.8■■■■□ 3.32
GTF3C4-202ENST00000483873 KCNQ2O43526 872 aa35.78■■■■□ 3.32
GTF3C4-202ENST00000483873 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
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GTF3C4-202ENST00000483873 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa35.76■■■■□ 3.31
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GTF3C4-202ENST00000483873 SULT6B1Q6IMI4 303 aa35.74■■■■□ 3.31
GTF3C4-202ENST00000483873 CYP27B1O15528 508 aa35.74■■■■□ 3.31
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GTF3C4-202ENST00000483873 KDRP35968 1356 aa35.73■■■■□ 3.31
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
GTF3C4-202ENST00000483873 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa35.72■■■■□ 3.31
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GTF3C4-202ENST00000483873 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa35.72■■■■□ 3.31
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GTF3C4-202ENST00000483873 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP35.69■■■■□ 3.3
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GTF3C4-202ENST00000483873 NUP188Q5SRE5 1749 aa35.68■■■■□ 3.3
GTF3C4-202ENST00000483873 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa35.68■■■■□ 3.3
GTF3C4-202ENST00000483873 CFAP53Q96M91 514 aa35.67■■■■□ 3.3
GTF3C4-202ENST00000483873 ITGB4P16144 1822 aa35.66■■■■□ 3.3
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GTF3C4-202ENST00000483873 PHKG2P15735 406 aa35.62■■■■□ 3.29
GTF3C4-202ENST00000483873 RALBP1Q15311 655 aa35.62■■■■□ 3.29
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GTF3C4-202ENST00000483873 IFNL2Q8IZJ0 200 aa35.59■■■■□ 3.29
GTF3C4-202ENST00000483873 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
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GTF3C4-202ENST00000483873 AMOTQ4VCS5 1084 aa35.57■■■■□ 3.28
GTF3C4-202ENST00000483873 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa35.56■■■■□ 3.28
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GTF3C4-202ENST00000483873 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
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GTF3C4-202ENST00000483873 LY75O60449 1722 aa35.52■■■■□ 3.28
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GTF3C4-202ENST00000483873 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
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GTF3C4-202ENST00000483873 DCAF5Q96JK2 942 aa35.44■■■■□ 3.26
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GTF3C4-202ENST00000483873 PAPPAQ13219 1627 aa35.42■■■■□ 3.26
GTF3C4-202ENST00000483873 AKAP4Q5JQC9 854 aa35.41■■■■□ 3.26
GTF3C4-202ENST00000483873 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
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GTF3C4-202ENST00000483873 LRRC4BQ9NT99 713 aa35.4■■■■□ 3.26
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GTF3C4-202ENST00000483873 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
GTF3C4-202ENST00000483873 ATG3Q9NT62 314 aa35.29■■■■□ 3.24
GTF3C4-202ENST00000483873 DLG5Q8TDM6 1919 aa35.28■■■■□ 3.24
GTF3C4-202ENST00000483873 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa35.28■■■■□ 3.24
GTF3C4-202ENST00000483873 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa35.27■■■■□ 3.24
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GTF3C4-202ENST00000483873 GNAT3A8MTJ3 354 aa35.25■■■■□ 3.23
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