RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482439.6

TBC1D15-208, Transcript of TBC1 domain family member 15, human

TSL 5

Gene TBC1D15, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D15-208	ENST00000482439	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
TBC1D15-208	ENST00000482439	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBC1D15-208	ENST00000482439	DCTN1	Q14203	1278 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBC1D15-208	ENST00000482439	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBC1D15-208	ENST00000482439	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
TBC1D15-208	ENST00000482439	IL16	Q14005	1332 aa		18.41	■□□□□ 0.54
TBC1D15-208	ENST00000482439	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
TBC1D15-208	ENST00000482439	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		18.4	■□□□□ 0.54
TBC1D15-208	ENST00000482439	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	18.39	■□□□□ 0.53	5e-6	■■■■□ 20.1
TBC1D15-208	ENST00000482439	CRB1	P82279	1406 aa		18.39	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	MEGF6	O75095	1541 aa		18.39	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	SLIT2	O94813	1529 aa		18.39	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	LRP6	O75581	1613 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	MCM10	Q7L590	875 aa		18.38	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	ZNF853	P0CG23	659 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		18.37	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	NRAP	Q86VF7	1730 aa		18.36	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	18.36	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	MAP3K5	Q99683	1374 aa		18.36	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	NGLY1	Q96IV0	654 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		18.35	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	IL2RB	P14784	551 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	C8orf37	Q96NL8	207 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	IFT57	Q9NWB7	429 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	SPG7	Q9UQ90	795 aa		18.34	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		18.33	■□□□□ 0.53
TBC1D15-208	ENST00000482439	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	LGR6	Q9HBX8	967 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	USP35	Q9P2H5	1018 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		18.33	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	CHL1	O00533	1208 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	GNAI1	P63096	354 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	CFAP44	Q96MT7	982 aa		18.32	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		18.31	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		18.31	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	CYP27B1	O15528	508 aa		18.31	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	PHKG2	P15735	406 aa		18.31	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		18.31	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	18.31	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		18.31	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	DISP2	A7MBM2	1401 aa		18.31	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		18.3	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		18.3	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	MBIP	Q9NS73	344 aa		18.3	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		18.3	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		18.29	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	VPS72	Q15906	364 aa		18.28	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		18.27	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	USP21	Q9UK80	565 aa		18.27	■□□□□ 0.52
TBC1D15-208	ENST00000482439	LRRC37A3	O60309	1634 aa		18.27	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	AFF2	P51816	1311 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	DCAF5	Q96JK2	942 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	EXOC5	O00471	708 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	RXRB	P28702	533 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	TSPYL6	Q8N831	410 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		18.22	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	VAMP4	O75379	141 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	TEF	Q10587	303 aa		18.21	■□□□□ 0.51
TBC1D15-208	ENST00000482439	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		18.2	■□□□□ 0.5

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