RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474181.1

UBE2Q1-203, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2Q1, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-203ENST00000474181 CHL1O00533 1208 aa16.34■□□□□ 0.21
UBE2Q1-203ENST00000474181 PLEKHG5O94827 1062 aa16.34■□□□□ 0.21
UBE2Q1-203ENST00000474181 GCP02774 474 aa16.34■□□□□ 0.21
UBE2Q1-203ENST00000474181 C8orf58Q8NAV2 365 aa16.34■□□□□ 0.21
UBE2Q1-203ENST00000474181 ARHGAP45Q92619 1136 aa16.34■□□□□ 0.21
UBE2Q1-203ENST00000474181 USP19O94966 1318 aa16.34■□□□□ 0.21
UBE2Q1-203ENST00000474181 KIAA0232Q92628 1395 aa16.34■□□□□ 0.21
UBE2Q1-203ENST00000474181 CRB1P82279 1406 aa16.34■□□□□ 0.21
UBE2Q1-203ENST00000474181 GNAT3A8MTJ3 354 aa16.33■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 IGHDP01880 384 aa16.33■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 PDE4AP27815 886 aa16.33■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 TMEM57Q8N5G2 664 aa16.33■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 MAP3K5Q99683 1374 aa16.33■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 LMTK3Q96Q04 1460 aa16.32■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 TSPYL4Q9UJ04 414 aa16.32■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 ALS2Q96Q42 1657 aa16.31■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 LRRC37A3O60309 1634 aa16.31■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 NPHP3Q7Z494 1330 aa16.31■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 RGS3P49796 1198 aa16.31■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 ARHGEF25Q86VW2 580 aa16.31■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 USHBP1Q8N6Y0 703 aa16.31■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa16.3■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa16.29■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 SKAP1Q86WV1 359 aa16.29■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 BACH2Q9BYV9 841 aa16.29■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 ANKRD24Q8TF21 1146 aa16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 NBPF6Q5VWK0 638 aa16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 NBPF4Q96M43 638 aa16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 STRCQ7RTU9 1775 aa16.27■□□□□ 0.2
UBE2Q1-203ENST00000474181 TNS3Q68CZ2 1445 aa16.27■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 ABCC4O15439 1325 aa16.26■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 BABAM1Q9NWV8 329 aa16.26■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 RGPD2P0DJD1 1756 aa16.26■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 FAM161AQ3B820 660 aa16.25■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 AMOTQ4VCS5 1084 aa16.25■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 ERICH6Q7L0X2 663 aa16.25■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16.25■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 MIS18AQ9NYP9 233 aa16.25■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 PTPRCP08575 1304 aa16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 KRT24Q2M2I5 525 aa16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 C1orf141Q5JVX7 400 aa16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 STK31Q9BXU1 1019 aa16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 LMO7Q8WWI1 1683 aa16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 PXDNQ92626 1479 aa16.22■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 NCAPD2Q15021 1401 aa16.22■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 IL17REQ8NFR9 667 aa16.22■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 AKAP4Q5JQC9 854 aa16.21■□□□□ 0.19
UBE2Q1-203ENST00000474181 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa16.2■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 ABCC6O95255 1503 aa16.2■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 TEFQ10587 303 aa16.2■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 CCDC30Q5VVM6 783 aa16.2■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 RGPD5Q99666 1765 aa16.19■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 SLC4A2P04920 1241 aa16.19■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa16.19■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 CHMP4AQ9BY43 222 aa16.19■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 ERBB3P21860 1342 aa16.19■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 BRINP3Q76B58 766 aa16.18■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa16.18■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 NLRP2Q9NX02 1062 aa16.18■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa16.18■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa16.17■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 AXIN2Q9Y2T1 843 aa16.17■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa16.16■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 TATP17735 454 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 C8orf34Q49A92 452 aa16.16■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 SMC5Q8IY18 1101 aa16.16■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 RGS12O14924 1447 aa16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 RNMTO43148 476 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 CABLES1Q8TDN4 633 aa16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 C1orf115Q9H7X2 142 aa16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 SLAIN2Q9P270 581 aa16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 KDM3BQ7LBC6 1761 aa16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1-203ENST00000474181 COL18A1P39060 1754 aa16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1-203ENST00000474181 CCT4P50991 539 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1-203ENST00000474181 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1-203ENST00000474181 GCC1Q96CN9 775 aa16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1-203ENST00000474181 DDRGK1Q96HY6 314 aa16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1-203ENST00000474181 LGR6Q9HBX8 967 aa16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1-203ENST00000474181 CPDO75976 1380 aa16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms