RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.77■■□□□ 1.24
SYNE4-204ENST00000465425 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SYNE4-204ENST00000465425 RGS12O14924 1447 aa22.77■■□□□ 1.24
SYNE4-204ENST00000465425 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.77■■□□□ 1.24
SYNE4-204ENST00000465425 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.76■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 SLC4A2P04920 1241 aa22.76■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 SSH2Q76I76 1423 aa22.76■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 FLT4P35916 1363 aa22.76■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 MSH6P52701 1360 aa22.76■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.76■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 CRB1P82279 1406 aa22.75■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 KIF2CQ99661 725 aa22.75■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 SBNO1A3KN83 1393 aa22.75■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 AMPHP49418 695 aa22.74■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 CEP85Q6P2H3 762 aa22.74■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.74■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 ATP10DQ9P241 1426 aa22.74■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.74■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.73■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 TBX22Q9Y458 520 aa22.73■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 RTL1A6NKG5 1358 aa22.72■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 FOXO3O43524 673 aa22.72■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 DDIT3P35638 169 aa22.72■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 TTC22Q5TAA0 569 aa22.72■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.72■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 MEIS3Q99687 375 aa22.71■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 TRAK2O60296 914 aa22.71■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.71■■□□□ 1.23
SYNE4-204ENST00000465425 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 KDRP35968 1356 aa22.69■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.69■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 APBB1O00213 710 aa22.69■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 HMMRO75330 724 aa22.69■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.69■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 CASC1Q6TDU7 716 aa22.68■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 EYA1Q99502 592 aa22.68■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 SLIT1O75093 1534 aa22.68■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.68■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.67■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 GBP4Q96PP9 640 aa22.67■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 DIP2AQ14689 1571 aa22.67■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 NLRP6P59044 892 aa22.66■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 STK31Q9BXU1 1019 aa22.66■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 ARXQ96QS3 562 aa22.66■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.66■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.65■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.64■■□□□ 1.22
SYNE4-204ENST00000465425 F6X3S4 739 aa22.64■■□□□ 1.21
SYNE4-204ENST00000465425 G2E3Q7L622 706 aa22.64■■□□□ 1.21
SYNE4-204ENST00000465425 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SYNE4-204ENST00000465425 RABEP1Q15276 862 aa22.63■■□□□ 1.21
SYNE4-204ENST00000465425 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SYNE4-204ENST00000465425 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SYNE4-204ENST00000465425 SDSP20132 328 aa22.62■■□□□ 1.21
SYNE4-204ENST00000465425 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.61■■□□□ 1.21
SYNE4-204ENST00000465425 FSD2A1L4K1 749 aa22.6■■□□□ 1.21
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.6■■□□□ 1.21
SYNE4-204ENST00000465425 USP26Q9BXU7 913 aa22.6■■□□□ 1.21
SYNE4-204ENST00000465425 PIK3C2AO00443 1686 aa22.6■■□□□ 1.21
SYNE4-204ENST00000465425 GNAI2P04899 355 aa22.6■■□□□ 1.21
SYNE4-204ENST00000465425 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SYNE4-204ENST00000465425 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.59■■□□□ 1.21
SYNE4-204ENST00000465425 PTMSP20962 102 aa22.59■■□□□ 1.21
SYNE4-204ENST00000465425 HOXC9P31274 260 aa22.59■■□□□ 1.21
SYNE4-204ENST00000465425 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.59■■□□□ 1.21
SYNE4-204ENST00000465425 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.59■■□□□ 1.21
SYNE4-204ENST00000465425 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SYNE4-204ENST00000465425 FLIIQ13045 1269 aa22.58■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 ABTB2Q8N961 1025 aa22.58■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 REC8O95072 547 aa22.57■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 GNAI3P08754 354 aa22.56■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 KCNA6P17658 529 aa22.56■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 NECTIN2Q92692 538 aa22.55■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.54■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 C14orf37Q86TY3 774 aa22.54■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 MAP3K5Q99683 1374 aa22.54■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 PDE1AP54750 535 aa22.54■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.54■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 MRE11P49959 708 aa22.53■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.53■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SYNE4-204ENST00000465425 ERC2O15083 957 aa22.53■■□□□ 1.2
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