RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 MON2Q7Z3U7 1717 aa10.75□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 AKAP12Q02952 1782 aa10.75□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 PLEKHG3A1L390 1219 aa10.74□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 UBAP1LF5GYI3 381 aa10.74□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 RLBP1P12271 317 aa10.74□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 TRIM27P14373 513 aa10.74□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 IL13P35225 146 aa10.74□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 GCC1Q96CN9 775 aa10.74□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa10.74□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 ZNF853P0CG23 659 aa10.73□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 PRKAR2BP31323 418 aa10.73□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 PRR36Q9H6K5 1346 aa10.73□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 NRKQ7Z2Y5 1582 aa10.73□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 NUTM2FA1L443 756 aa10.72□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 POTEMA6NI47 508 aa10.72□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 CD44P16070 742 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 ITPRIPQ8IWB1 547 aa10.72□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 TBC1D32Q96NH3 1257 aa10.72□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 SLAIN2Q9P270 581 aa10.72□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 PHLPP1O60346 1717 aa10.71□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 ESCO1Q5FWF5 840 aa10.71□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 NPHP3Q7Z494 1330 aa10.71□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa10.71□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP10.71□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 TTC21AQ8NDW8 1320 aa10.71□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.71□□□□□ -0.69
ACTB-208ENST00000464611 VAMP4O75379 141 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 NFKBIBQ15653 356 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 BRINP3Q76B58 766 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 DCBLD2Q96PD2 775 aa10.7□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 KIAA0232Q92628 1395 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 USP19O94966 1318 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 NUCB1Q02818 461 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 GSE1Q14687 1217 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 BCL2L13Q9BXK5 485 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 CHMP4AQ9BY43 222 aa10.69□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 PXDNQ92626 1479 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 USP6P35125 1406 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 PIP4K2BP78356 416 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 TMEM57Q8N5G2 664 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 ORAI2Q96SN7 254 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 BCL11AQ9H165 835 aa10.68□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 USP31Q70CQ4 1352 aa10.67□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 ACEP12821 1306 aa10.67□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 CLCN6P51797 869 aa10.67□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 POTEGQ6S5H5 508 aa10.67□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 SKAP1Q86WV1 359 aa10.67□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.67□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 TNS3Q68CZ2 1445 aa10.67□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 USP54Q70EL1 1684 aa10.66□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 ALS2Q96Q42 1657 aa10.66□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 SBNO1A3KN83 1393 aa10.66□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 ABCC4O15439 1325 aa10.66□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 PSME1Q06323 249 aa10.66□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 BMP2KLQ5H9B9 411 aa10.66□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 CHD1LQ86WJ1 897 aa10.66□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 NME9Q86XW9 330 aa10.66□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 IL27Q8NEV9 243 aa10.66□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 PTPRCP08575 1304 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 PTMSP20962 102 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 OTUD5Q96G74 571 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 PHACTR3Q96KR7 559 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 C22orf23Q9BZE7 217 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 BABAM1Q9NWV8 329 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 PIK3C2AO00443 1686 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
ACTB-208ENST00000464611 ARHGEF10O15013 1369 aa10.65□□□□□ -0.71
ACTB-208ENST00000464611 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
ACTB-208ENST00000464611 CHL1O00533 1208 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTB-208ENST00000464611 FOXO3O43524 673 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTB-208ENST00000464611 PRR29P0C7W0 189 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTB-208ENST00000464611 RBM25P49756 843 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
ACTB-208ENST00000464611 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
ACTB-208ENST00000464611 FBXO41Q8TF61 875 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTB-208ENST00000464611 SNX21Q969T3 373 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTB-208ENST00000464611 MBIPQ9NS73 344 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTB-208ENST00000464611 TNNQ9UQP3 1299 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTB-208ENST00000464611 HMOX1P09601 288 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTB-208ENST00000464611 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTB-208ENST00000464611 OVOS2Q6IE36 1432 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTB-208ENST00000464611 SSH2Q76I76 1423 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTB-208ENST00000464611 ABCA3Q99758 1704 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTB-208ENST00000464611 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
ACTB-208ENST00000464611 SEC24BO95487 1268 aa10.62□□□□□ -0.71
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