RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 DCCP43146 1447 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 RTL1A6NKG5 1358 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 MAP3K13O43283 966 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 RIPK4P57078 832 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 RASEFQ8IZ41 740 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRC-210ENST00000462363 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa7.34□□□□□ -1.23
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PTPRC-210ENST00000462363 COL18A1P39060 1754 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-210ENST00000462363 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-210ENST00000462363 LMTK3Q96Q04 1460 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-210ENST00000462363 NUTM2FA1L443 756 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRC-210ENST00000462363 AAMPQ13685 434 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRC-210ENST00000462363 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-210ENST00000462363 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa7.33□□□□□ -1.24
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PTPRC-210ENST00000462363 TNNQ9UQP3 1299 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRC-210ENST00000462363 USP19O94966 1318 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTPRC-210ENST00000462363 HMOX1P09601 288 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-210ENST00000462363 MS4A1P11836 297 aa7.32□□□□□ -1.24
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PTPRC-210ENST00000462363 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF428Q96B54 188 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-210ENST00000462363 IFT57Q9NWB7 429 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-210ENST00000462363 PHF8Q9UPP1 1060 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-210ENST00000462363 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRC-210ENST00000462363 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-210ENST00000462363 ALDH1L2Q3SY69 923 aa7.31□□□□□ -1.24
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PTPRC-210ENST00000462363 PANK1Q8TE04 598 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-210ENST00000462363 SSH1Q8WYL5 1049 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-210ENST00000462363 ABCC6O95255 1503 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-210ENST00000462363 MSH6P52701 1360 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-210ENST00000462363 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRC-210ENST00000462363 KDM3BQ7LBC6 1761 aa7.31□□□□□ -1.24
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PTPRC-210ENST00000462363 RGPD5Q99666 1765 aa7.3□□□□□ -1.24
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PTPRC-210ENST00000462363 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-210ENST00000462363 CFAP44Q96MT7 982 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTPRC-210ENST00000462363 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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PTPRC-210ENST00000462363 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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PTPRC-210ENST00000462363 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa7.28□□□□□ -1.24
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PTPRC-210ENST00000462363 ABCC4O15439 1325 aa7.27□□□□□ -1.24
PTPRC-210ENST00000462363 KIF16BQ96L93 1317 aa7.27□□□□□ -1.24
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PTPRC-210ENST00000462363 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa7.27□□□□□ -1.25
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PTPRC-210ENST00000462363 TSPYL6Q8N831 410 aa7.27□□□□□ -1.25
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PTPRC-210ENST00000462363 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.27□□□□□ -1.25
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PTPRC-210ENST00000462363 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-210ENST00000462363 C8orf58Q8NAV2 365 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-210ENST00000462363 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-210ENST00000462363 C19orf44Q9H6X5 657 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-210ENST00000462363 SMC4Q9NTJ3 1288 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-210ENST00000462363 PKD1L3Q7Z443 1732 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-210ENST00000462363 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.26□□□□□ -1.25
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