RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-204ENST00000452765 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
SH3BP2-204ENST00000452765 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.2■■□□□ 1.95
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SH3BP2-204ENST00000452765 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP2-204ENST00000452765 MEGF6O75095 1541 aa27.18■■□□□ 1.94
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SH3BP2-204ENST00000452765 LGR6Q9HBX8 967 aa27.17■■□□□ 1.94
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SH3BP2-204ENST00000452765 BCL2L13Q9BXK5 485 aa27.14■■□□□ 1.94
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SH3BP2-204ENST00000452765 SSH1Q8WYL5 1049 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP2-204ENST00000452765 TNNQ9UQP3 1299 aa27■■□□□ 1.91
SH3BP2-204ENST00000452765 NGLY1Q96IV0 654 aa27■■□□□ 1.91
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SH3BP2-204ENST00000452765 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.91
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SH3BP2-204ENST00000452765 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.91■■□□□ 1.9
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SH3BP2-204ENST00000452765 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.91■■□□□ 1.9
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC39A6Q13433 755 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-204ENST00000452765 PANK1Q8TE04 598 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-204ENST00000452765 NECTIN2Q92692 538 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-204ENST00000452765 BCL9LQ86UU0 1499 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP2-204ENST00000452765 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-204ENST00000452765 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-204ENST00000452765 UNC5CLQ8IV45 518 aa26.89■■□□□ 1.9
SH3BP2-204ENST00000452765 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
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