RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 APBA3O96018 575 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-206ENST00000443528 IL13P35225 146 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-206ENST00000443528 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-206ENST00000443528 SBF2Q86WG5 1849 aa21.31■■□□□ 1
ACTB-206ENST00000443528 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
ACTB-206ENST00000443528 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
ACTB-206ENST00000443528 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-206ENST00000443528 KCNQ2O43526 872 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-206ENST00000443528 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.28■■□□□ 1
ACTB-206ENST00000443528 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
ACTB-206ENST00000443528 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
ACTB-206ENST00000443528 CYP27B1O15528 508 aa21.25■□□□□ 0.99
ACTB-206ENST00000443528 PPP2R1AP30153 589 aa21.25■□□□□ 0.99
ACTB-206ENST00000443528 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.25■□□□□ 0.99
ACTB-206ENST00000443528 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.25■□□□□ 0.99
ACTB-206ENST00000443528 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.25■□□□□ 0.99
ACTB-206ENST00000443528 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-206ENST00000443528 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
ACTB-206ENST00000443528 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.24■□□□□ 0.99
ACTB-206ENST00000443528 NHSQ6T4R5 1651 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-206ENST00000443528 PLSCR1O15162 318 aa21.23■□□□□ 0.99
ACTB-206ENST00000443528 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.23■□□□□ 0.99
ACTB-206ENST00000443528 SPG7Q9UQ90 795 aa21.23■□□□□ 0.99
ACTB-206ENST00000443528 KDRP35968 1356 aa21.23■□□□□ 0.99
ACTB-206ENST00000443528 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.23■□□□□ 0.99
ACTB-206ENST00000443528 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa21.22■□□□□ 0.99
ACTB-206ENST00000443528 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
ACTB-206ENST00000443528 DOT1LQ8TEK3 1739 aa21.18■□□□□ 0.98
ACTB-206ENST00000443528 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
ACTB-206ENST00000443528 PROM2Q8N271 834 aa21.18■□□□□ 0.98
ACTB-206ENST00000443528 RREB1Q92766 1687 aa21.18■□□□□ 0.98
ACTB-206ENST00000443528 HMOX1P09601 288 aa21.17■□□□□ 0.98
ACTB-206ENST00000443528 PHKG2P15735 406 aa21.17■□□□□ 0.98
ACTB-206ENST00000443528 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
ACTB-206ENST00000443528 CFAP53Q96M91 514 aa21.17■□□□□ 0.98
ACTB-206ENST00000443528 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
ACTB-206ENST00000443528 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.16■□□□□ 0.98
ACTB-206ENST00000443528 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
ACTB-206ENST00000443528 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.16■□□□□ 0.98
ACTB-206ENST00000443528 BTAF1O14981 1849 aa21.15■□□□□ 0.98
ACTB-206ENST00000443528 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
ACTB-206ENST00000443528 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.15■□□□□ 0.98
ACTB-206ENST00000443528 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
ACTB-206ENST00000443528 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-206ENST00000443528 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-206ENST00000443528 RALBP1Q15311 655 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-206ENST00000443528 TXNRD1Q16881 649 aa21.13■□□□□ 0.97
ACTB-206ENST00000443528 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
ACTB-206ENST00000443528 KAT6BQ8WYB5 2073 aa21.1■□□□□ 0.97
ACTB-206ENST00000443528 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-206ENST00000443528 NUDCQ9Y266 331 aa21.09■□□□□ 0.97
ACTB-206ENST00000443528 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
ACTB-206ENST00000443528 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 PIGBQ92521 554 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 DCAF5Q96JK2 942 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.07■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 NBPF14Q5TI25 921 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 ITGB4P16144 1822 aa21.06■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.05■□□□□ 0.963e-42■□□□□ 8.5
ACTB-206ENST00000443528 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.05■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 PRKAR2BP31323 418 aa21.03■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 KCNQ4P56696 695 aa21.03■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 LY75O60449 1722 aa21.02■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 FCHSD2O94868 740 aa21.02■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.02■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.02■□□□□ 0.96
ACTB-206ENST00000443528 PAPPAQ13219 1627 aa21.01■□□□□ 0.95
ACTB-206ENST00000443528 PALLDQ8WX93 1383 aa21.01■□□□□ 0.95
ACTB-206ENST00000443528 LGR6Q9HBX8 967 aa21.01■□□□□ 0.95
ACTB-206ENST00000443528 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-206ENST00000443528 CABP4P57796 275 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-206ENST00000443528 SLC15A2Q16348 729 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-206ENST00000443528 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
ACTB-206ENST00000443528 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
ACTB-206ENST00000443528 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
ACTB-206ENST00000443528 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-206ENST00000443528 ATG3Q9NT62 314 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-206ENST00000443528 STK32BQ9NY57 414 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-206ENST00000443528 ZNF827Q17R98 1081 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-206ENST00000443528 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-206ENST00000443528 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-206ENST00000443528 AKT1S1Q96B36 256 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-206ENST00000443528 MAP3K5Q99683 1374 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-206ENST00000443528 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-206ENST00000443528 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.95■□□□□ 0.94
ACTB-206ENST00000443528 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-206ENST00000443528 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-206ENST00000443528 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
ACTB-206ENST00000443528 MRC1P22897 1456 aa20.94■□□□□ 0.94
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