RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 FAM177BA6PVY3 158 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 APBB1O00213 710 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 PFDN1O60925 122 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 PSEN1P49768 467 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 NEUROD2Q15784 382 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 SATB2Q9UPW6 733 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 ATP2B1P20020 1258 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 USP6NLQ92738 828 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM11Q96F44 468 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 TAOK3Q9H2K8 898 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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PTPRC-209ENST00000442510 PTPN14Q15678 1187 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 KLHL10Q6JEL2 608 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 LRRCC1Q9C099 1032 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 PAX3P23760 479 aa6.55□□□□□ -1.36
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PTPRC-209ENST00000442510 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 VIMP08670 466 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 CEP135Q66GS9 1140 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC50Q8IVM0 306 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 GTF3C6Q969F1 213 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 ETAA1Q9NY74 926 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 C16orf87Q6PH81 154 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGA5Q8TBA6 731 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 HSPA4P34932 840 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 MAGEA9P43362 315 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 CEP112Q8N8E3 955 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 JMYQ8N9B5 988 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 MPP4Q96JB8 637 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 SCLT1Q96NL6 688 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM5Q9C035 493 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 ROCK1Q13464 1354 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 ST18O60284 1047 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 PRR29P0C7W0 189 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 SYT10Q6XYQ8 523 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 INPP5BP32019 993 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC80Q76M96 950 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 MAP9Q49MG5 647 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 NEK11Q8NG66 645 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 REC8O95072 547 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 PSMD7P51665 324 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 HHATQ5VTY9 493 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 C17orf50Q8WW18 174 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 CREB3O43889 395 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 MECOMQ03112 1051 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF365Q70YC5 407 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 EFCAB13Q8IY85 973 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 SMTNL1A8MU46 457 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 CAGE1Q8TC20 777 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 C22orf23Q9BZE7 217 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 EXOC1Q9NV70 894 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-209ENST00000442510 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 TEX11Q8IYF3 940 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 ATL2Q8NHH9 583 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 TSC1Q92574 1164 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 FRMD3A2A2Y4 597 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 ERC2O15083 957 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 PAX7P23759 505 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 DEUP1Q05D60 604 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 PDE3BQ13370 1112 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-209ENST00000442510 SGSM3Q96HU1 749 aa6.52□□□□□ -1.37
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