RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
SH3BP2-202ENST00000435136 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
SH3BP2-202ENST00000435136 PXDNQ92626 1479 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP2-202ENST00000435136 HOXC9P31274 260 aa23.78■■□□□ 1.4
SH3BP2-202ENST00000435136 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
SH3BP2-202ENST00000435136 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-202ENST00000435136 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-202ENST00000435136 PSME1Q06323 249 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-202ENST00000435136 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-202ENST00000435136 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-202ENST00000435136 KIAA0232Q92628 1395 aa23.77■■□□□ 1.4
SH3BP2-202ENST00000435136 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 LRRC37A3O60309 1634 aa23.76■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 SLIT3O75094 1523 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 CHL1O00533 1208 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 SOX12O15370 315 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 EYA1Q99502 592 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.75■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 CRB1P82279 1406 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM83GA6ND36 823 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 MSH5O43196 834 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM161AQ3B820 660 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 LRP6O75581 1613 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
SH3BP2-202ENST00000435136 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 IP6K1Q92551 441 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 PLEKHG5O94827 1062 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 TSPYL6Q8N831 410 aa23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 DCTN1Q14203 1278 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.68■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 ABCC4O15439 1325 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 SKAP1Q86WV1 359 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 ADAMTS2O95450 1211 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 USP19O94966 1318 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 C8orf34Q49A92 452 aa23.64■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 MCM10Q7L590 875 aa23.64■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.64■■□□□ 1.38
SH3BP2-202ENST00000435136 RGS3P49796 1198 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-202ENST00000435136 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-202ENST00000435136 ALS2Q96Q42 1657 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-202ENST00000435136 NCAPD2Q15021 1401 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-202ENST00000435136 ILDR2Q71H61 639 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-202ENST00000435136 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-202ENST00000435136 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-202ENST00000435136 MAP3K5Q99683 1374 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-202ENST00000435136 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-202ENST00000435136 C8orf37Q96NL8 207 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-202ENST00000435136 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-202ENST00000435136 PTPRCP08575 1304 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-202ENST00000435136 SMC5Q8IY18 1101 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-202ENST00000435136 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-202ENST00000435136 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-202ENST00000435136 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-202ENST00000435136 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-202ENST00000435136 POTEAQ6S8J7 498 aa23.58■■□□□ 1.36
SH3BP2-202ENST00000435136 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.58■■□□□ 1.36
SH3BP2-202ENST00000435136 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-202ENST00000435136 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-202ENST00000435136 GCP02774 474 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-202ENST00000435136 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-202ENST00000435136 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP2-202ENST00000435136 ABCC6O95255 1503 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP2-202ENST00000435136 NGLY1Q96IV0 654 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP2-202ENST00000435136 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-202ENST00000435136 RGS12O14924 1447 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-202ENST00000435136 CACNA1FO60840 1977 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-202ENST00000435136 AFF2P51816 1311 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-202ENST00000435136 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-202ENST00000435136 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-202ENST00000435136 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-202ENST00000435136 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-202ENST00000435136 MYT1Q01538 1121 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-202ENST00000435136 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-202ENST00000435136 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-202ENST00000435136 NBPF4Q96M43 638 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-202ENST00000435136 GCC1Q96CN9 775 aa23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms