RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429285.6

NCOR2-208, Transcript of nuclear receptor corepressor 2, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NCOR2, Length 8,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCOR2-208	ENST00000429285	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	15.58	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		15.57	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		15.57	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	DAAM2	Q86T65	1068 aa		15.57	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		15.57	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	MAP3K11	Q16584	847 aa		15.57	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	15.57	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		15.56	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	15.56	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	15.56	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		15.56	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	BACH2	Q9BYV9	841 aa		15.56	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	15.56	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		15.56	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		15.55	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		15.55	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	CFAP100	Q494V2	611 aa		15.55	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		15.55	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	SOGA3	Q5TF21	947 aa		15.55	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		15.54	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	15.54	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	15.54	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	15.54	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	15.54	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	GNAI2	P04899	355 aa		15.54	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		15.54	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	15.54	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	PANK1	Q8TE04	598 aa		15.53	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	15.53	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	FER	P16591	822 aa		15.53	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	PAFAH1B1	P43034	410 aa		15.53	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		15.53	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		15.53	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	MTMR7	Q9Y216	660 aa		15.53	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	TUBB	P07437	444 aa		15.53	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	15.53	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	SEPT6	Q14141	434 aa		15.53	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	GOPC	Q9HD26	462 aa		15.53	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		15.53	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	15.52	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	15.52	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	15.52	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	15.52	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	15.52	■□□□□ 0.08
NCOR2-208	ENST00000429285	MCM4	P33991	863 aa		15.52	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	UBE4A	Q14139	1066 aa		15.52	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	15.52	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		15.52	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		15.52	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	15.52	■□□□□ 0.07	4e-7	■■■■□ 21.1
NCOR2-208	ENST00000429285	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	15.52	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	MNAT1	P51948	309 aa		15.51	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	15.51	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		15.51	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	SETSIP	P0DME0	302 aa		15.51	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	PSME1	Q06323	249 aa		15.51	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	CBX1	P83916	185 aa		15.51	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		15.51	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	NUTM2F	A1L443	756 aa		15.51	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285		A6NNZ2	444 aa		15.5	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		15.5	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	HSPA4	P34932	840 aa		15.5	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		15.5	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	15.5	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		15.5	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		15.5	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	FSD2	A1L4K1	749 aa		15.5	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	SPECC1	Q5M775	1068 aa		15.5	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	TSG101	Q99816	390 aa		15.5	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	15.5	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		15.5	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		15.5	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	ANO10	Q9NW15	660 aa		15.49	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		15.49	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	ZWINT	O95229	277 aa		15.48	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	HS1BP3	Q53T59	392 aa		15.48	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		15.48	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	DAPK1	P53355	1430 aa		15.48	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		15.48	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	CEP112	Q8N8E3	955 aa		15.48	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	KDM4A	O75164	1064 aa		15.48	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	WDR63	Q8IWG1	891 aa		15.48	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		15.48	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		15.47	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		15.47	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		15.47	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	HFM1	A2PYH4	1435 aa		15.47	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	UVSSA	Q2YD98	709 aa		15.47	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
NCOR2-208	ENST00000429285	KRT222	Q8N1A0	295 aa		15.47	■□□□□ 0.07

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