RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-201ENST00000418331 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-201ENST00000418331 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRJ-201ENST00000418331 JMYQ8N9B5 988 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM22Q8IYM9 498 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRJ-201ENST00000418331 PDRG1Q9NUG6 133 aa25.44■■□□□ 1.66
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PTPRJ-201ENST00000418331 NSD2O96028 1365 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-201ENST00000418331 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-201ENST00000418331 MNS1Q8NEH6 495 aa25.43■■□□□ 1.66
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PTPRJ-201ENST00000418331 F6X3S4 739 aa25.39■■□□□ 1.65
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PTPRJ-201ENST00000418331 HYPKQ9NX55 129 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PTPRJ-201ENST00000418331 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRJ-201ENST00000418331 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PTPRJ-201ENST00000418331 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PTPRJ-201ENST00000418331 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PTPRJ-201ENST00000418331 SMARCE1Q969G3 411 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRJ-201ENST00000418331 KRT18P05783 430 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
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