RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409178.5

C10orf55-201, Transcript of chromosome 10 open reading frame 55, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C10orf55, Length 2,513 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55-201ENST00000409178 PIK3C2AO00443 1686 aa27.1■■□□□ 1.93
C10orf55-201ENST00000409178 NLRP6P59044 892 aa27.09■■□□□ 1.93
C10orf55-201ENST00000409178 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
C10orf55-201ENST00000409178 KIAA0232Q92628 1395 aa27.09■■□□□ 1.93
C10orf55-201ENST00000409178 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa27.09■■□□□ 1.93
C10orf55-201ENST00000409178 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
C10orf55-201ENST00000409178 GSE1Q14687 1217 aa27.08■■□□□ 1.93
C10orf55-201ENST00000409178 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.08■■□□□ 1.93
C10orf55-201ENST00000409178 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.92
C10orf55-201ENST00000409178 BMP2KLQ5H9B9 411 aa27.07■■□□□ 1.92
C10orf55-201ENST00000409178 KDRP35968 1356 aa27.06■■□□□ 1.92
C10orf55-201ENST00000409178 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
C10orf55-201ENST00000409178 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.05■■□□□ 1.92
C10orf55-201ENST00000409178 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.05■■□□□ 1.92
C10orf55-201ENST00000409178 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.04■■□□□ 1.92
C10orf55-201ENST00000409178 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
C10orf55-201ENST00000409178 MSH6P52701 1360 aa27.03■■□□□ 1.92
C10orf55-201ENST00000409178 SLC4A2P04920 1241 aa27.03■■□□□ 1.92
C10orf55-201ENST00000409178 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.02■■□□□ 1.92
C10orf55-201ENST00000409178 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 ATP10DQ9P241 1426 aa27■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 HOXC9P31274 260 aa27■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 PTPRCP08575 1304 aa27■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 ABTB2Q8N961 1025 aa26.99■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 MEIS3Q99687 375 aa26.99■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 G2E3Q7L622 706 aa26.99■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 DCTPP1Q9H773 170 aa26.99■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.98■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 RBM25P49756 843 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa26.98■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.98■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 CEP85Q6P2H3 762 aa26.97■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 C14orf37Q86TY3 774 aa26.97■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 RTL1A6NKG5 1358 aa26.96■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 F6X3S4 739 aa26.96■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa26.95■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
C10orf55-201ENST00000409178 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.93■■□□□ 1.9
C10orf55-201ENST00000409178 NWD1Q149M9 1564 aa26.93■■□□□ 1.9
C10orf55-201ENST00000409178 HSCBQ8IWL3 235 aa26.93■■□□□ 1.9
C10orf55-201ENST00000409178 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.92■■□□□ 1.9
C10orf55-201ENST00000409178 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
C10orf55-201ENST00000409178 APBB1O00213 710 aa26.92■■□□□ 1.9
C10orf55-201ENST00000409178 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
C10orf55-201ENST00000409178 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.91■■□□□ 1.9
C10orf55-201ENST00000409178 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
C10orf55-201ENST00000409178 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.9■■□□□ 1.9
C10orf55-201ENST00000409178 NECTIN2Q92692 538 aa26.9■■□□□ 1.9
C10orf55-201ENST00000409178 KIF2CQ99661 725 aa26.9■■□□□ 1.9
C10orf55-201ENST00000409178 IL17REQ8NFR9 667 aa26.88■■□□□ 1.89
C10orf55-201ENST00000409178 CDC45O75419 566 aa26.88■■□□□ 1.89
C10orf55-201ENST00000409178 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
C10orf55-201ENST00000409178 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.87■■□□□ 1.89
C10orf55-201ENST00000409178 TTC22Q5TAA0 569 aa26.86■■□□□ 1.89
C10orf55-201ENST00000409178 LRRC37A3O60309 1634 aa26.86■■□□□ 1.89
C10orf55-201ENST00000409178 MAP3K5Q99683 1374 aa26.86■■□□□ 1.89
C10orf55-201ENST00000409178 STK31Q9BXU1 1019 aa26.85■■□□□ 1.89
C10orf55-201ENST00000409178 IL27Q8NEV9 243 aa26.84■■□□□ 1.89
C10orf55-201ENST00000409178 SNX21Q969T3 373 aa26.84■■□□□ 1.89
C10orf55-201ENST00000409178 CHMP5Q9NZZ3 219 aa26.84■■□□□ 1.89
C10orf55-201ENST00000409178 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
C10orf55-201ENST00000409178 USP54Q70EL1 1684 aa26.83■■□□□ 1.89
C10orf55-201ENST00000409178 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
C10orf55-201ENST00000409178 FLIIQ13045 1269 aa26.83■■□□□ 1.89
C10orf55-201ENST00000409178 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
C10orf55-201ENST00000409178 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.82■■□□□ 1.88
C10orf55-201ENST00000409178 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.81■■□□□ 1.88
C10orf55-201ENST00000409178 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
C10orf55-201ENST00000409178 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.81■■□□□ 1.88
C10orf55-201ENST00000409178 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.81■■□□□ 1.88
C10orf55-201ENST00000409178 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.8■■□□□ 1.88
C10orf55-201ENST00000409178 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
C10orf55-201ENST00000409178 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
C10orf55-201ENST00000409178 PSME1Q06323 249 aa26.78■■□□□ 1.88
C10orf55-201ENST00000409178 IP6K1Q92551 441 aa26.78■■□□□ 1.88
C10orf55-201ENST00000409178 PLEKHG5O94827 1062 aa26.78■■□□□ 1.88
C10orf55-201ENST00000409178 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
C10orf55-201ENST00000409178 MCM4P33991 863 aa26.78■■□□□ 1.88
C10orf55-201ENST00000409178 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.78■■□□□ 1.88
C10orf55-201ENST00000409178 NBPF4Q96M43 638 aa26.78■■□□□ 1.88
C10orf55-201ENST00000409178 HMMRO75330 724 aa26.77■■□□□ 1.88
C10orf55-201ENST00000409178 DDIT3P35638 169 aa26.77■■□□□ 1.88
C10orf55-201ENST00000409178 SDSP20132 328 aa26.77■■□□□ 1.88
C10orf55-201ENST00000409178 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
C10orf55-201ENST00000409178 LTN1O94822 1766 aa26.76■■□□□ 1.88
C10orf55-201ENST00000409178 GNAI2P04899 355 aa26.76■■□□□ 1.87
C10orf55-201ENST00000409178 NFAT5O94916 1531 aa26.76■■□□□ 1.87
C10orf55-201ENST00000409178 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa26.75■■□□□ 1.87
C10orf55-201ENST00000409178 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
C10orf55-201ENST00000409178 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.74■■□□□ 1.87
C10orf55-201ENST00000409178 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.74■■□□□ 1.87
C10orf55-201ENST00000409178 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
C10orf55-201ENST00000409178 LGR6Q9HBX8 967 aa26.73■■□□□ 1.87
C10orf55-201ENST00000409178 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.71■■□□□ 1.87
C10orf55-201ENST00000409178 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa26.71■■□□□ 1.87
C10orf55-201ENST00000409178 ORAI2Q96SN7 254 aa26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms