RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399211.7

KRT17P1-201, Transcript of keratin 17 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene KRT17P1, Length 1,546 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17P1-201ENST00000399211 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
KRT17P1-201ENST00000399211 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
KRT17P1-201ENST00000399211 PPP2R1AP30153 589 aa27.66■■■□□ 2.02
KRT17P1-201ENST00000399211 BCL9O00512 1426 aa27.66■■■□□ 2.02
KRT17P1-201ENST00000399211 PKD1L3Q7Z443 1732 aa27.65■■■□□ 2.02
KRT17P1-201ENST00000399211 AEBP1Q8IUX7 1158 aa27.65■■■□□ 2.02
KRT17P1-201ENST00000399211 PARD3Q8TEW0 1356 aa27.64■■■□□ 2.01
KRT17P1-201ENST00000399211 ACSBG1Q96GR2 724 aa27.63■■■□□ 2.01
KRT17P1-201ENST00000399211 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
KRT17P1-201ENST00000399211 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
KRT17P1-201ENST00000399211 NHSQ6T4R5 1651 aa27.61■■■□□ 2.01
KRT17P1-201ENST00000399211 KCNQ2O43526 872 aa27.61■■■□□ 2.01
KRT17P1-201ENST00000399211 APBA3O96018 575 aa27.61■■■□□ 2.01
KRT17P1-201ENST00000399211 BAG6P46379 1132 aa27.61■■■□□ 2.01
KRT17P1-201ENST00000399211 KAT6BQ8WYB5 2073 aa27.6■■■□□ 2.01
KRT17P1-201ENST00000399211 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
KRT17P1-201ENST00000399211 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27.6■■■□□ 2.01
KRT17P1-201ENST00000399211 DOT1LQ8TEK3 1739 aa27.59■■■□□ 2.01
KRT17P1-201ENST00000399211 CYP27B1O15528 508 aa27.58■■■□□ 2.01
KRT17P1-201ENST00000399211 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
KRT17P1-201ENST00000399211 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa27.57■■■□□ 2
KRT17P1-201ENST00000399211 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa27.57■■■□□ 2
KRT17P1-201ENST00000399211 KDRP35968 1356 aa27.56■■■□□ 2
KRT17P1-201ENST00000399211 HMOX1P09601 288 aa27.56■■■□□ 2
KRT17P1-201ENST00000399211 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
KRT17P1-201ENST00000399211 CAMKK2Q96RR4 588 aa27.54■■■□□ 2
KRT17P1-201ENST00000399211 SPG7Q9UQ90 795 aa27.53■■■□□ 2
KRT17P1-201ENST00000399211 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.53■■■□□ 2
KRT17P1-201ENST00000399211 BTAF1O14981 1849 aa27.53■■■□□ 2
KRT17P1-201ENST00000399211 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
KRT17P1-201ENST00000399211 CFAP53Q96M91 514 aa27.52■■■□□ 2
KRT17P1-201ENST00000399211 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP27.51■■■□□ 2
KRT17P1-201ENST00000399211 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
KRT17P1-201ENST00000399211 RREB1Q92766 1687 aa27.49■■□□□ 1.99
KRT17P1-201ENST00000399211 RALBP1Q15311 655 aa27.49■■□□□ 1.99
KRT17P1-201ENST00000399211 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
KRT17P1-201ENST00000399211 PHKG2P15735 406 aa27.48■■□□□ 1.99
KRT17P1-201ENST00000399211 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.48■■□□□ 1.99
KRT17P1-201ENST00000399211 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
KRT17P1-201ENST00000399211 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa27.47■■□□□ 1.99
KRT17P1-201ENST00000399211 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
KRT17P1-201ENST00000399211 IFNL2Q8IZJ0 200 aa27.46■■□□□ 1.99
KRT17P1-201ENST00000399211 NUP188Q5SRE5 1749 aa27.46■■□□□ 1.99
KRT17P1-201ENST00000399211 PLSCR1O15162 318 aa27.45■■□□□ 1.98
KRT17P1-201ENST00000399211 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
KRT17P1-201ENST00000399211 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
KRT17P1-201ENST00000399211 ITGB4P16144 1822 aa27.45■■□□□ 1.98
KRT17P1-201ENST00000399211 AMOTQ4VCS5 1084 aa27.43■■□□□ 1.98
KRT17P1-201ENST00000399211 PROM2Q8N271 834 aa27.42■■□□□ 1.98
KRT17P1-201ENST00000399211 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
KRT17P1-201ENST00000399211 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
KRT17P1-201ENST00000399211 NUDCQ9Y266 331 aa27.41■■□□□ 1.98
KRT17P1-201ENST00000399211 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
KRT17P1-201ENST00000399211 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.4■■□□□ 1.98
KRT17P1-201ENST00000399211 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.39■■□□□ 1.98
KRT17P1-201ENST00000399211 RSPH6AQ9H0K4 717 aa27.39■■□□□ 1.98
KRT17P1-201ENST00000399211 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
KRT17P1-201ENST00000399211 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
KRT17P1-201ENST00000399211 TXNRD1Q16881 649 aa27.37■■□□□ 1.97
KRT17P1-201ENST00000399211 PRKAR2BP31323 418 aa27.36■■□□□ 1.97
KRT17P1-201ENST00000399211 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.36■■□□□ 1.97
KRT17P1-201ENST00000399211 PIGBQ92521 554 aa27.35■■□□□ 1.97
KRT17P1-201ENST00000399211 PHACTR3Q96KR7 559 aa27.34■■□□□ 1.97
KRT17P1-201ENST00000399211 LY75O60449 1722 aa27.34■■□□□ 1.97
KRT17P1-201ENST00000399211 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
KRT17P1-201ENST00000399211 DCAF5Q96JK2 942 aa27.33■■□□□ 1.97
KRT17P1-201ENST00000399211 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
KRT17P1-201ENST00000399211 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.33■■□□□ 1.96
KRT17P1-201ENST00000399211 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
KRT17P1-201ENST00000399211 KCNQ4P56696 695 aa27.31■■□□□ 1.96
KRT17P1-201ENST00000399211 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.31■■□□□ 1.96
KRT17P1-201ENST00000399211 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
KRT17P1-201ENST00000399211 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.31■■□□□ 1.96
KRT17P1-201ENST00000399211 TMOD3Q9NYL9 352 aa27.31■■□□□ 1.96
KRT17P1-201ENST00000399211 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
KRT17P1-201ENST00000399211 FCHSD2O94868 740 aa27.29■■□□□ 1.96
KRT17P1-201ENST00000399211 LGR6Q9HBX8 967 aa27.29■■□□□ 1.96
KRT17P1-201ENST00000399211 PAPPAQ13219 1627 aa27.28■■□□□ 1.96
KRT17P1-201ENST00000399211 PALLDQ8WX93 1383 aa27.27■■□□□ 1.96
KRT17P1-201ENST00000399211 ERVV-2B6SEH9 535 aa27.27■■□□□ 1.96
KRT17P1-201ENST00000399211 ASAP1Q9ULH1 1129 aa27.26■■□□□ 1.96
KRT17P1-201ENST00000399211 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa27.26■■□□□ 1.96
KRT17P1-201ENST00000399211 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.26■■□□□ 1.95
KRT17P1-201ENST00000399211 RNMTO43148 476 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
KRT17P1-201ENST00000399211 CABP4P57796 275 aa27.25■■□□□ 1.95
KRT17P1-201ENST00000399211 NBPF14Q5TI25 921 aa27.25■■□□□ 1.95
KRT17P1-201ENST00000399211 MAP3K5Q99683 1374 aa27.23■■□□□ 1.95
KRT17P1-201ENST00000399211 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa27.23■■□□□ 1.95
KRT17P1-201ENST00000399211 ATG3Q9NT62 314 aa27.23■■□□□ 1.95
KRT17P1-201ENST00000399211 CCDC184Q52MB2 194 aa27.22■■□□□ 1.95
KRT17P1-201ENST00000399211 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.22■■□□□ 1.95
KRT17P1-201ENST00000399211 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.22■■□□□ 1.95
KRT17P1-201ENST00000399211 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
KRT17P1-201ENST00000399211 MRC1P22897 1456 aa27.21■■□□□ 1.95
KRT17P1-201ENST00000399211 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
KRT17P1-201ENST00000399211 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.2■■□□□ 1.94
KRT17P1-201ENST00000399211 ZNF827Q17R98 1081 aa27.2■■□□□ 1.94
KRT17P1-201ENST00000399211 ANP32CO43423 234 aa27.19■■□□□ 1.94
KRT17P1-201ENST00000399211 IL17REQ8NFR9 667 aa27.19■■□□□ 1.94
KRT17P1-201ENST00000399211 SLC52A2Q9HAB3 445 aa27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms