RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MEGF6O75095 1541 aa20.58■□□□□ 0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RGPD5Q99666 1765 aa20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM182BQ5T319 152 aa20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUDCQ9Y266 331 aa20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRRC37A3O60309 1634 aa20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KDRP35968 1356 aa20.55■□□□□ 0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPG7Q9UQ90 795 aa20.54■□□□□ 0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.53■□□□□ 0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.53■□□□□ 0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.53■□□□□ 0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.52■□□□□ 0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM37O94972 964 aa20.49■□□□□ 0.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.49■□□□□ 0.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BAG6P46379 1132 aa20.47■□□□□ 0.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WNK3Q9BYP7 1800 aa20.47■□□□□ 0.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EP400Q96L91 3159 aa20.47■□□□□ 0.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYP27B1O15528 508 aa20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.46■□□□□ 0.87
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BRWD3Q6RI45 1802 aa20.45■□□□□ 0.86
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HMOX1P09601 288 aa20.44■□□□□ 0.86
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PHKG2P15735 406 aa20.44■□□□□ 0.86
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANP32CO43423 234 aa20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FCHSD2O94868 740 aa20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP2-201ENST00000398621 APBA3O96018 575 aa20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP2-201ENST00000398621 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP2-201ENST00000398621 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLSCR1O15162 318 aa20.41■□□□□ 0.86
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.4■□□□□ 0.86
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.4■□□□□ 0.86
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.4■□□□□ 0.86
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNQ2O43526 872 aa20.39■□□□□ 0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.39■□□□□ 0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DCAF5Q96JK2 942 aa20.39■□□□□ 0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRKAR2BP31323 418 aa20.38■□□□□ 0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.38■□□□□ 0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.38■□□□□ 0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RGPD2P0DJD1 1756 aa20.37■□□□□ 0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.37■□□□□ 0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.36■□□□□ 0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEFMP07197 916 aa20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.35■□□□□ 0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.31■□□□□ 0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NHSQ6T4R5 1651 aa20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.3■□□□□ 0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.29■□□□□ 0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIGBQ92521 554 aa20.29■□□□□ 0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAP3K5Q99683 1374 aa20.29■□□□□ 0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CABP4P57796 275 aa20.28■□□□□ 0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TXNRD1Q16881 649 aa20.28■□□□□ 0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC27A3Q5K4L6 730 aa20.28■□□□□ 0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.27■□□□□ 0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC4A2P04920 1241 aa20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NBPF14Q5TI25 921 aa20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PROM2Q8N271 834 aa20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PALLDQ8WX93 1383 aa20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NFE2L2Q16236 605 aa20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LGR6Q9HBX8 967 aa20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRS2Q9HD23 443 aa20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RUNDC1Q96C34 613 aa20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.21■□□□□ 0.83
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
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