RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 PKD1L3Q7Z443 1732 aa27.56■■■□□ 2
CLDN3-201ENST00000395145 PPP2R1AP30153 589 aa27.56■■■□□ 2
CLDN3-201ENST00000395145 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
CLDN3-201ENST00000395145 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
CLDN3-201ENST00000395145 TRIM37O94972 964 aa27.52■■■□□ 2
CLDN3-201ENST00000395145 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
CLDN3-201ENST00000395145 KDRP35968 1356 aa27.51■■□□□ 1.99
CLDN3-201ENST00000395145 RALBP1Q15311 655 aa27.49■■□□□ 1.99
CLDN3-201ENST00000395145 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
CLDN3-201ENST00000395145 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP27.49■■□□□ 1.99
CLDN3-201ENST00000395145 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa27.48■■□□□ 1.99
CLDN3-201ENST00000395145 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa27.48■■□□□ 1.99
CLDN3-201ENST00000395145 CFAP53Q96M91 514 aa27.48■■□□□ 1.99
CLDN3-201ENST00000395145 NHSQ6T4R5 1651 aa27.47■■□□□ 1.99
CLDN3-201ENST00000395145 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27.46■■□□□ 1.99
CLDN3-201ENST00000395145 AEBP1Q8IUX7 1158 aa27.46■■□□□ 1.99
CLDN3-201ENST00000395145 BAG6P46379 1132 aa27.45■■□□□ 1.98
CLDN3-201ENST00000395145 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
CLDN3-201ENST00000395145 SPG7Q9UQ90 795 aa27.45■■□□□ 1.98
CLDN3-201ENST00000395145 DEFB132Q7Z7B7 95 aa27.44■■□□□ 1.98
CLDN3-201ENST00000395145 CYP27B1O15528 508 aa27.43■■□□□ 1.98
CLDN3-201ENST00000395145 DOT1LQ8TEK3 1739 aa27.41■■□□□ 1.98
CLDN3-201ENST00000395145 KAT6BQ8WYB5 2073 aa27.41■■□□□ 1.98
CLDN3-201ENST00000395145 APBA3O96018 575 aa27.41■■□□□ 1.98
CLDN3-201ENST00000395145 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
CLDN3-201ENST00000395145 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa27.4■■□□□ 1.98
CLDN3-201ENST00000395145 PTF1AQ7RTS3 328 aa27.4■■□□□ 1.98
CLDN3-201ENST00000395145 AMOTQ4VCS5 1084 aa27.39■■□□□ 1.98
CLDN3-201ENST00000395145 ACSBG1Q96GR2 724 aa27.39■■□□□ 1.98
CLDN3-201ENST00000395145 KCNQ2O43526 872 aa27.38■■□□□ 1.97
CLDN3-201ENST00000395145 HMOX1P09601 288 aa27.38■■□□□ 1.97
CLDN3-201ENST00000395145 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CLDN3-201ENST00000395145 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CLDN3-201ENST00000395145 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CLDN3-201ENST00000395145 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CLDN3-201ENST00000395145 CAMKK2Q96RR4 588 aa27.37■■□□□ 1.97
CLDN3-201ENST00000395145 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CLDN3-201ENST00000395145 NUDCQ9Y266 331 aa27.37■■□□□ 1.97
CLDN3-201ENST00000395145 BTAF1O14981 1849 aa27.37■■□□□ 1.97
CLDN3-201ENST00000395145 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CLDN3-201ENST00000395145 IFNL2Q8IZJ0 200 aa27.36■■□□□ 1.97
CLDN3-201ENST00000395145 PLSCR1O15162 318 aa27.35■■□□□ 1.97
CLDN3-201ENST00000395145 PHKG2P15735 406 aa27.35■■□□□ 1.97
CLDN3-201ENST00000395145 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.35■■□□□ 1.97
CLDN3-201ENST00000395145 RREB1Q92766 1687 aa27.34■■□□□ 1.97
CLDN3-201ENST00000395145 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CLDN3-201ENST00000395145 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CLDN3-201ENST00000395145 ITGB4P16144 1822 aa27.3■■□□□ 1.96
CLDN3-201ENST00000395145 RSPH6AQ9H0K4 717 aa27.29■■□□□ 1.96
CLDN3-201ENST00000395145 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
CLDN3-201ENST00000395145 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
CLDN3-201ENST00000395145 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.28■■□□□ 1.96
CLDN3-201ENST00000395145 NUP188Q5SRE5 1749 aa27.27■■□□□ 1.96
CLDN3-201ENST00000395145 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
CLDN3-201ENST00000395145 FCHSD2O94868 740 aa27.26■■□□□ 1.95
CLDN3-201ENST00000395145 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.26■■□□□ 1.95
CLDN3-201ENST00000395145 DCAF5Q96JK2 942 aa27.25■■□□□ 1.95
CLDN3-201ENST00000395145 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
CLDN3-201ENST00000395145 PRKAR2BP31323 418 aa27.24■■□□□ 1.95
CLDN3-201ENST00000395145 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CLDN3-201ENST00000395145 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.24■■□□□ 1.95
CLDN3-201ENST00000395145 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.22■■□□□ 1.95
CLDN3-201ENST00000395145 PROM2Q8N271 834 aa27.22■■□□□ 1.95
CLDN3-201ENST00000395145 LY75O60449 1722 aa27.21■■□□□ 1.95
CLDN3-201ENST00000395145 ERVV-2B6SEH9 535 aa27.21■■□□□ 1.95
CLDN3-201ENST00000395145 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa27.21■■□□□ 1.95
CLDN3-201ENST00000395145 TXNRD1Q16881 649 aa27.2■■□□□ 1.94
CLDN3-201ENST00000395145 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.2■■□□□ 1.94
CLDN3-201ENST00000395145 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.2■■□□□ 1.94
CLDN3-201ENST00000395145 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
CLDN3-201ENST00000395145 PIGBQ92521 554 aa27.19■■□□□ 1.94
CLDN3-201ENST00000395145 PHACTR3Q96KR7 559 aa27.19■■□□□ 1.94
CLDN3-201ENST00000395145 TMOD3Q9NYL9 352 aa27.18■■□□□ 1.94
CLDN3-201ENST00000395145 ANP32CO43423 234 aa27.16■■□□□ 1.94
CLDN3-201ENST00000395145 MRC1P22897 1456 aa27.15■■□□□ 1.94
CLDN3-201ENST00000395145 MAP3K5Q99683 1374 aa27.15■■□□□ 1.94
CLDN3-201ENST00000395145 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.14■■□□□ 1.94
CLDN3-201ENST00000395145 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.14■■□□□ 1.94
CLDN3-201ENST00000395145 PAPPAQ13219 1627 aa27.13■■□□□ 1.93
CLDN3-201ENST00000395145 RNMTO43148 476 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CLDN3-201ENST00000395145 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CLDN3-201ENST00000395145 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CLDN3-201ENST00000395145 PALLDQ8WX93 1383 aa27.12■■□□□ 1.93
CLDN3-201ENST00000395145 CABP4P57796 275 aa27.12■■□□□ 1.93
CLDN3-201ENST00000395145 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.11■■□□□ 1.93
CLDN3-201ENST00000395145 NBPF14Q5TI25 921 aa27.11■■□□□ 1.93
CLDN3-201ENST00000395145 LGR6Q9HBX8 967 aa27.11■■□□□ 1.93
CLDN3-201ENST00000395145 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.11■■□□□ 1.93
CLDN3-201ENST00000395145 NEFMP07197 916 aa27.09■■□□□ 1.93
CLDN3-201ENST00000395145 SLC52A2Q9HAB3 445 aa27.09■■□□□ 1.93
CLDN3-201ENST00000395145 ASAP1Q9ULH1 1129 aa27.09■■□□□ 1.93
CLDN3-201ENST00000395145 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.08■■□□□ 1.93
CLDN3-201ENST00000395145 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
CLDN3-201ENST00000395145 ATG3Q9NT62 314 aa27.08■■□□□ 1.93
CLDN3-201ENST00000395145 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa27.07■■□□□ 1.92
CLDN3-201ENST00000395145 IL17REQ8NFR9 667 aa27.06■■□□□ 1.92
CLDN3-201ENST00000395145 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
CLDN3-201ENST00000395145 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa27.06■■□□□ 1.92
CLDN3-201ENST00000395145 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms