RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394285.3

PDCL-202, Transcript of phosducin like, humanhuman

TSL 3

Gene PDCL, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-202ENST00000394285 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PDCL-202ENST00000394285 NBPF14Q5TI25 921 aa14.92□□□□□ -0.02
PDCL-202ENST00000394285 PTF1AQ7RTS3 328 aa14.92□□□□□ -0.02
PDCL-202ENST00000394285 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.92□□□□□ -0.02
PDCL-202ENST00000394285 MEGF6O75095 1541 aa14.92□□□□□ -0.02
PDCL-202ENST00000394285 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.92□□□□□ -0.02
PDCL-202ENST00000394285 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.92□□□□□ -0.02
PDCL-202ENST00000394285 IL13P35225 146 aa14.9□□□□□ -0.02
PDCL-202ENST00000394285 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
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PDCL-202ENST00000394285 ACSBG1Q96GR2 724 aa14.9□□□□□ -0.02
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PDCL-202ENST00000394285 AMOTQ4VCS5 1084 aa14.88□□□□□ -0.03
PDCL-202ENST00000394285 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa14.88□□□□□ -0.03
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PDCL-202ENST00000394285 WNK3Q9BYP7 1800 aa14.87□□□□□ -0.03
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PDCL-202ENST00000394285 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PDCL-202ENST00000394285 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PDCL-202ENST00000394285 SLC27A3Q5K4L6 730 aa14.85□□□□□ -0.03
PDCL-202ENST00000394285 KDRP35968 1356 aa14.85□□□□□ -0.03
PDCL-202ENST00000394285 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PDCL-202ENST00000394285 PHKG2P15735 406 aa14.84□□□□□ -0.03
PDCL-202ENST00000394285 SULT6B1Q6IMI4 303 aa14.84□□□□□ -0.03
PDCL-202ENST00000394285 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PDCL-202ENST00000394285 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PDCL-202ENST00000394285 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
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PDCL-202ENST00000394285 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PDCL-202ENST00000394285 DCAF5Q96JK2 942 aa14.81□□□□□ -0.04
PDCL-202ENST00000394285 ERVV-2B6SEH9 535 aa14.8□□□□□ -0.04
PDCL-202ENST00000394285 SLC15A2Q16348 729 aa14.8□□□□□ -0.04
PDCL-202ENST00000394285 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.8□□□□□ -0.04
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PDCL-202ENST00000394285 NUDCQ9Y266 331 aa14.8□□□□□ -0.04
PDCL-202ENST00000394285 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
PDCL-202ENST00000394285 NHSQ6T4R5 1651 aa14.79□□□□□ -0.04
PDCL-202ENST00000394285 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa14.79□□□□□ -0.04
PDCL-202ENST00000394285 SBF2Q86WG5 1849 aa14.79□□□□□ -0.04
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PDCL-202ENST00000394285 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PDCL-202ENST00000394285 RGPD2P0DJD1 1756 aa14.78□□□□□ -0.04
PDCL-202ENST00000394285 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa14.78□□□□□ -0.04
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PDCL-202ENST00000394285 SPON1Q9HCB6 807 aa14.74□□□□□ -0.05
PDCL-202ENST00000394285 PKD1L3Q7Z443 1732 aa14.74□□□□□ -0.05
PDCL-202ENST00000394285 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PDCL-202ENST00000394285 PALLDQ8WX93 1383 aa14.73□□□□□ -0.05
PDCL-202ENST00000394285 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PDCL-202ENST00000394285 SLC16A10Q8TF71 515 aa14.73□□□□□ -0.05
PDCL-202ENST00000394285 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.72□□□□□ -0.05
PDCL-202ENST00000394285 ATG3Q9NT62 314 aa14.72□□□□□ -0.05
PDCL-202ENST00000394285 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.71□□□□□ -0.05
PDCL-202ENST00000394285 SIK1P57059 783 aa14.71□□□□□ -0.05
PDCL-202ENST00000394285 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.71□□□□□ -0.05
PDCL-202ENST00000394285 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.71□□□□□ -0.05
PDCL-202ENST00000394285 NUP188Q5SRE5 1749 aa14.71□□□□□ -0.05
PDCL-202ENST00000394285 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
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PDCL-202ENST00000394285 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
PDCL-202ENST00000394285 ZNF827Q17R98 1081 aa14.7□□□□□ -0.06
PDCL-202ENST00000394285 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.7□□□□□ -0.06
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PDCL-202ENST00000394285 MTFR1LQ9H019 292 aa14.7□□□□□ -0.06
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PDCL-202ENST00000394285 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa14.7□□□□□ -0.06
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PDCL-202ENST00000394285 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.69□□□□□ -0.06
PDCL-202ENST00000394285 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PDCL-202ENST00000394285 PRKAR2BP31323 418 aa14.68□□□□□ -0.06
PDCL-202ENST00000394285 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PDCL-202ENST00000394285 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PDCL-202ENST00000394285 LGR6Q9HBX8 967 aa14.68□□□□□ -0.06
PDCL-202ENST00000394285 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.67□□□□□ -0.06
PDCL-202ENST00000394285 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.66□□□□□ -0.06
PDCL-202ENST00000394285 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PDCL-202ENST00000394285 ATP6V1AP38606 617 aa14.66□□□□□ -0.06
PDCL-202ENST00000394285 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.66□□□□□ -0.06
PDCL-202ENST00000394285 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa14.66□□□□□ -0.06
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