RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 DKK1O94907 266 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 FAM69CQ0P6D2 419 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 DPYDQ12882 1025 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 SPRYD7Q5W111 196 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 FAM200AQ8TCP9 573 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 MRGPRX2Q96LB1 330 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 ADH1CP00326 375 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 MYCP01106 439 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 SCTRP47872 440 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 ERVK-9P63128 1117 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRC-205ENST00000391970 TPCN2Q8NHX9 752 aa5.66□□□□□ -1.5
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PTPRC-205ENST00000391970 PSME1Q06323 249 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 NR5A1Q13285 461 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 SWI5Q1ZZU3 235 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF697Q5TEC3 545 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC102BQ68D86 513 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC116Q8IYX3 515 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRC-205ENST00000391970 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRC-205ENST00000391970 SEC13P55735 322 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 OSBPL3Q9H4L5 887 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 CYLDQ9NQC7 956 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 LILRA1O75019 489 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 NR3C2P08235 984 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM52Q96A61 297 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 PRKD2Q9BZL6 878 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 PKD2L1Q9P0L9 805 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 V9GY48 417 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 SFI1A8K8P3 1242 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 M0R2N6 131 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 ALDH1A1P00352 501 aa5.62□□□□□ -1.51
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PTPRC-205ENST00000391970 MYT1Q01538 1121 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM229AB2RXF0 380 aa5.61□□□□□ -1.51
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PTPRC-205ENST00000391970 ATP2B4P23634 1241 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 SCNN1DP51172 638 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 FOXC1Q12948 553 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 NNTQ13423 1086 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF358Q9NW07 568 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 GDF9O60383 454 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 OCLNQ16625 522 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 CYP2U1Q7Z449 544 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 TXNDC2Q86VQ3 553 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 WASF2Q9Y6W5 498 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 PRMT3O60678 531 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 STAU1O95793 577 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 ADD1P35611 737 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 GDF10P55107 478 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 C1orf216Q8TAB5 229 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 ETNK1Q9HBU6 452 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRC-205ENST00000391970 J3QL48 77 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 GNRH1P01148 92 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 INHAP05111 366 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 PRIMPOLQ96LW4 560 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 TOR4AQ9NXH8 423 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
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PTPRC-205ENST00000391970 ADH1AP07327 375 aa5.57□□□□□ -1.52
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PTPRC-205ENST00000391970 WEE1P30291 646 aa5.57□□□□□ -1.52
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PTPRC-205ENST00000391970 TAS1R3Q7RTX0 852 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 CYP4X1Q8N118 509 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 ITPKCQ96DU7 683 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 HINFPQ9BQA5 517 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 WDR4P57081 412 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 PRR20EP86478 221 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 PRR20CP86479 221 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 PRR20DP86480 221 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 PRR20BP86481 221 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRC-205ENST00000391970 PRR20AP86496 221 aa5.56□□□□□ -1.52
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