RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370546.5

HPSE2-201, Transcript of heparanase 2 (inactive), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPSE2, Length 1,849 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSE2-201ENST00000370546 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
HPSE2-201ENST00000370546 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
HPSE2-201ENST00000370546 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.09■□□□□ 0.17
HPSE2-201ENST00000370546 PLEKHG3A1L390 1219 aa16.08■□□□□ 0.17
HPSE2-201ENST00000370546 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa16.08■□□□□ 0.17
HPSE2-201ENST00000370546 ARHGEF10O15013 1369 aa16.08■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 MRE11P49959 708 aa16.08■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 DCTN1Q14203 1278 aa16.08■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 TTC22Q5TAA0 569 aa16.08■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 SULT6B1Q6IMI4 303 aa16.08■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa16.07■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 AEBP1Q8IUX7 1158 aa16.06■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 CRB1P82279 1406 aa16.06■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 RABEP1Q15276 862 aa16.05■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 ACEP12821 1306 aa16.05■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 RTL1A6NKG5 1358 aa16.05■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 MSH6P52701 1360 aa16.05■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 SSH2Q76I76 1423 aa16.05■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 CEP85Q6P2H3 762 aa16.04■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 CLEC17AQ6ZS10 378 aa16.03■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 TTC21AQ8NDW8 1320 aa16.03■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 LRRC37A3O60309 1634 aa16.02■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 CASC1Q6TDU7 716 aa16.02■□□□□ 0.16
HPSE2-201ENST00000370546 MCM10Q7L590 875 aa16.01■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 SBNO1A3KN83 1393 aa16.01■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 KDRP35968 1356 aa16.01■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 HMMRO75330 724 aa16.01■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 GRPEL1Q9HAV7 217 aa16.01■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 FLT4P35916 1363 aa16■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 KRT24Q2M2I5 525 aa16■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 GOLGA6L22H0YM25 854 aa15.99■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa15.99■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 GAS2L2Q8NHY3 880 aa15.99■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 USP26Q9BXU7 913 aa15.99■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 PTPRUQ92729 1446 aa15.99■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 CCT4P50991 539 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 MEIS3Q99687 375 aa15.98■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 PANK2Q9BZ23 570 aa15.98■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 DIP2AQ14689 1571 aa15.98■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 USP54Q70EL1 1684 aa15.98■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 SDSP20132 328 aa15.97■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 MAP3K19Q56UN5 1328 aa15.97■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 REC8O95072 547 aa15.96■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 NUCB2P80303 420 aa15.96■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 ARXQ96QS3 562 aa15.96■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 OSBPL3Q9H4L5 887 aa15.96■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 SLIT1O75093 1534 aa15.96■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 CACNA1FO60840 1977 aa15.96■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa15.96■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 PIK3C2AO00443 1686 aa15.96■□□□□ 0.15
HPSE2-201ENST00000370546 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 SLC4A2P04920 1241 aa15.96■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 IGSF1Q8N6C5 1336 aa15.95■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 SSFA2P28290 1259 aa15.95■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 FOXD4L1Q9NU39 408 aa15.95■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 TSPYL4Q9UJ04 414 aa15.95■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 ARHGAP23Q9P227 1491 aa15.95■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 ST18O60284 1047 aa15.94■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 LTKP29376 864 aa15.94■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 PXDNLA1KZ92 1463 aa15.93■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.93■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 ERC2O15083 957 aa15.93■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 BAG4O95429 457 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 KLHL40Q2TBA0 621 aa15.93■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 CLCN1P35523 988 aa15.92■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 GNAI2P04899 355 aa15.91■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.91■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 STK31Q9BXU1 1019 aa15.91■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 EID1Q9Y6B2 187 aa15.91■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 PDE1AP54750 535 aa15.91■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 GNAI3P08754 354 aa15.9■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 G2E3Q7L622 706 aa15.9■□□□□ 0.14
HPSE2-201ENST00000370546 BABAM1Q9NWV8 329 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms