RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368309.3

UBQLN4-201, Transcript of ubiquilin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN4, Length 3,576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4-201ENST00000368309 KIF2CQ99661 725 aa22.54■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 MCM4P33991 863 aa22.54■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 NLRP6P59044 892 aa22.53■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.53■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 TBX22Q9Y458 520 aa22.53■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 PEAK1Q9H792 1746 aa22.53■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 G2E3Q7L622 706 aa22.53■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.53■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 SSH2Q76I76 1423 aa22.53■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 F6X3S4 739 aa22.53■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 RGS12O14924 1447 aa22.52■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 CEP85Q6P2H3 762 aa22.52■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 KIAA0232Q92628 1395 aa22.52■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.52■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.52■■□□□ 1.2
UBQLN4-201ENST00000368309 CRB1P82279 1406 aa22.52■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 ARXQ96QS3 562 aa22.51■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.51■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 MSH6P52701 1360 aa22.51■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.51■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 SNX21Q969T3 373 aa22.5■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 CDC45O75419 566 aa22.5■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 PTPRCP08575 1304 aa22.49■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 FLT4P35916 1363 aa22.49■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 NECTIN2Q92692 538 aa22.48■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 SBNO1A3KN83 1393 aa22.48■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 RTL1A6NKG5 1358 aa22.48■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 ARHGEF10O15013 1369 aa22.48■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 ATP10DQ9P241 1426 aa22.47■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 KCNA6P17658 529 aa22.47■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.47■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 TTC22Q5TAA0 569 aa22.47■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 C14orf37Q86TY3 774 aa22.45■■□□□ 1.19
UBQLN4-201ENST00000368309 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.44■■□□□ 1.18
UBQLN4-201ENST00000368309 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.44■■□□□ 1.18
UBQLN4-201ENST00000368309 DDIT3P35638 169 aa22.44■■□□□ 1.18
UBQLN4-201ENST00000368309 ABTB2Q8N961 1025 aa22.44■■□□□ 1.18
UBQLN4-201ENST00000368309 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
UBQLN4-201ENST00000368309 TRAK2O60296 914 aa22.43■■□□□ 1.18
UBQLN4-201ENST00000368309 KDRP35968 1356 aa22.42■■□□□ 1.18
UBQLN4-201ENST00000368309 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
UBQLN4-201ENST00000368309 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
UBQLN4-201ENST00000368309 SDSP20132 328 aa22.42■■□□□ 1.18
UBQLN4-201ENST00000368309 HOXC9P31274 260 aa22.42■■□□□ 1.18
UBQLN4-201ENST00000368309 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.41■■□□□ 1.18
UBQLN4-201ENST00000368309 STK31Q9BXU1 1019 aa22.41■■□□□ 1.18
UBQLN4-201ENST00000368309 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
UBQLN4-201ENST00000368309 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
UBQLN4-201ENST00000368309 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.4■■□□□ 1.18
UBQLN4-201ENST00000368309 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.4■■□□□ 1.18
UBQLN4-201ENST00000368309 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.4■■□□□ 1.18
UBQLN4-201ENST00000368309 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.4■■□□□ 1.18
UBQLN4-201ENST00000368309 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
UBQLN4-201ENST00000368309 DIP2AQ14689 1571 aa22.39■■□□□ 1.18
UBQLN4-201ENST00000368309 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
UBQLN4-201ENST00000368309 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
UBQLN4-201ENST00000368309 IL17REQ8NFR9 667 aa22.39■■□□□ 1.17
UBQLN4-201ENST00000368309 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.38■■□□□ 1.17
UBQLN4-201ENST00000368309 SLIT1O75093 1534 aa22.38■■□□□ 1.17
UBQLN4-201ENST00000368309 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.38■■□□□ 1.17
UBQLN4-201ENST00000368309 HMMRO75330 724 aa22.37■■□□□ 1.17
UBQLN4-201ENST00000368309 FLIIQ13045 1269 aa22.37■■□□□ 1.17
UBQLN4-201ENST00000368309 USP26Q9BXU7 913 aa22.37■■□□□ 1.17
UBQLN4-201ENST00000368309 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.35■■□□□ 1.17
UBQLN4-201ENST00000368309 PLEKHG5O94827 1062 aa22.35■■□□□ 1.17
UBQLN4-201ENST00000368309 GNAI2P04899 355 aa22.35■■□□□ 1.17
UBQLN4-201ENST00000368309 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.35■■□□□ 1.17
UBQLN4-201ENST00000368309 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
UBQLN4-201ENST00000368309 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.34■■□□□ 1.17
UBQLN4-201ENST00000368309 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.34■■□□□ 1.17
UBQLN4-201ENST00000368309 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.34■■□□□ 1.17
UBQLN4-201ENST00000368309 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.34■■□□□ 1.17
UBQLN4-201ENST00000368309 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
UBQLN4-201ENST00000368309 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
UBQLN4-201ENST00000368309 PIK3C2AO00443 1686 aa22.32■■□□□ 1.16
UBQLN4-201ENST00000368309 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
UBQLN4-201ENST00000368309 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
UBQLN4-201ENST00000368309 CASC1Q6TDU7 716 aa22.32■■□□□ 1.16
UBQLN4-201ENST00000368309 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.32■■□□□ 1.16
UBQLN4-201ENST00000368309 PDE1AP54750 535 aa22.32■■□□□ 1.16
UBQLN4-201ENST00000368309 RABEP1Q15276 862 aa22.31■■□□□ 1.16
UBQLN4-201ENST00000368309 SSFA2P28290 1259 aa22.3■■□□□ 1.16
UBQLN4-201ENST00000368309 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.3■■□□□ 1.16
UBQLN4-201ENST00000368309 GBP4Q96PP9 640 aa22.3■■□□□ 1.16
UBQLN4-201ENST00000368309 MAP3K5Q99683 1374 aa22.29■■□□□ 1.16
UBQLN4-201ENST00000368309 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.29■■□□□ 1.16
UBQLN4-201ENST00000368309 FSD2A1L4K1 749 aa22.29■■□□□ 1.16
UBQLN4-201ENST00000368309 PANK2Q9BZ23 570 aa22.29■■□□□ 1.16
UBQLN4-201ENST00000368309 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
UBQLN4-201ENST00000368309 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66 ms