RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366662.8

TTC13-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-202ENST00000366662 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
TTC13-202ENST00000366662 ABCC4O15439 1325 aa21.44■■□□□ 1.02
TTC13-202ENST00000366662 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TTC13-202ENST00000366662 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.43■■□□□ 1.02
TTC13-202ENST00000366662 ZNF428Q96B54 188 aa21.43■■□□□ 1.02
TTC13-202ENST00000366662 MEIS3Q99687 375 aa21.43■■□□□ 1.02
TTC13-202ENST00000366662 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TTC13-202ENST00000366662 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC13-202ENST00000366662 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TTC13-202ENST00000366662 BECN1Q14457 450 aa21.42■■□□□ 1.02
TTC13-202ENST00000366662 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
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TTC13-202ENST00000366662 SSH2Q76I76 1423 aa21.4■■□□□ 1.02
TTC13-202ENST00000366662 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.4■■□□□ 1.02
TTC13-202ENST00000366662 HOXC9P31274 260 aa21.39■■□□□ 1.01
TTC13-202ENST00000366662 USP31Q70CQ4 1352 aa21.39■■□□□ 1.01
TTC13-202ENST00000366662 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
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TTC13-202ENST00000366662 PIK3R4Q99570 1358 aa21.37■■□□□ 1.01
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TTC13-202ENST00000366662 ARXQ96QS3 562 aa21.36■■□□□ 1.01
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TTC13-202ENST00000366662 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.34■■□□□ 1.01
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TTC13-202ENST00000366662 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
TTC13-202ENST00000366662 GCC1Q96CN9 775 aa21.34■■□□□ 1.01
TTC13-202ENST00000366662 ORAI2Q96SN7 254 aa21.34■■□□□ 1.01
TTC13-202ENST00000366662 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.34■■□□□ 1.01
TTC13-202ENST00000366662 PSME1Q06323 249 aa21.33■■□□□ 1.01
TTC13-202ENST00000366662 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.33■■□□□ 1.01
TTC13-202ENST00000366662 SLIT1O75093 1534 aa21.32■■□□□ 1
TTC13-202ENST00000366662 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.32■■□□□ 1
TTC13-202ENST00000366662 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.32■■□□□ 1
TTC13-202ENST00000366662 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
TTC13-202ENST00000366662 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
TTC13-202ENST00000366662 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.32■■□□□ 1
TTC13-202ENST00000366662 RGS12O14924 1447 aa21.31■■□□□ 1
TTC13-202ENST00000366662 CEP85Q6P2H3 762 aa21.31■■□□□ 1
TTC13-202ENST00000366662 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.31■■□□□ 1
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TTC13-202ENST00000366662 DCTPP1Q9H773 170 aa21.28■■□□□ 1
TTC13-202ENST00000366662 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.28■■□□□ 1
TTC13-202ENST00000366662 KCNQ3O43525 872 aa21.27■■□□□ 1
TTC13-202ENST00000366662 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.27■■□□□ 1
TTC13-202ENST00000366662 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
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TTC13-202ENST00000366662 STK31Q9BXU1 1019 aa21.26■□□□□ 0.99
TTC13-202ENST00000366662 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
TTC13-202ENST00000366662 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
TTC13-202ENST00000366662 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
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TTC13-202ENST00000366662 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
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TTC13-202ENST00000366662 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
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TTC13-202ENST00000366662 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
TTC13-202ENST00000366662 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
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TTC13-202ENST00000366662 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.18■□□□□ 0.98
TTC13-202ENST00000366662 IP6K1Q92551 441 aa21.18■□□□□ 0.98
TTC13-202ENST00000366662 MAP3K5Q99683 1374 aa21.18■□□□□ 0.98
TTC13-202ENST00000366662 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
TTC13-202ENST00000366662 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
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