RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364561.1

RNU6-1277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1277P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GATA4P43694 442 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HYAL1Q12794 435 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CCDC142Q17RM4 750 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 C6orf118Q5T5N4 469 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CHADLQ6NUI6 762 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 WDR24Q96S15 920 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KCNK17Q96T54 332 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PCED1AQ9H1Q7 454 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ENAMQ9NRM1 1142 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RNF112Q9ULX5 631 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ADAMTS20P59510 1910 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HERC2O95714 4834 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FBN2P35556 2912 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MED26O95402 600 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CHRNA4P43681 627 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PTTG1IPP53801 180 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRT76Q01546 638 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SCARF1Q14162 830 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NBPF9Q3BBW0 867 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ADGRD1Q6QNK2 874 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RIC3Q7Z5B4 369 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF710Q8N1W2 664 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 A0A0A0MRY4 1105 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DDNO94850 711 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KCNQ4P56696 695 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TGFB2P61812 414 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SKOR1P84550 965 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GRIN2CQ14957 1233 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NBPF1Q3BBV0 1214 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DGKKQ5KSL6 1271 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AMIGO3Q86WK7 504 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PALD1Q9ULE6 856 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TADA3O75528 432 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AVPP01185 164 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TACR2P21452 398 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BMP6P22004 513 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SSTR4P31391 388 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EFEMP1Q12805 493 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF628Q5EBL2 1059 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 DBF4BQ8NFT6 615 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NTN4Q9HB63 628 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PARD6AQ9NPB6 346 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TPSG1Q9NRR2 321 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PIM2Q9P1W9 311 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HIVEP2P31629 2446 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 AGRNO00468 2067 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TNFRSF10AO00220 468 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CDK4P11802 303 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 RFX1P22670 979 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 OLFM4Q6UX06 510 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM214BQ7L5A3 538 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ANKLE2Q86XL3 938 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SMRP1Q8NCR6 262 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MAP6Q96JE9 813 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TMEM209Q96SK2 561 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 MLXIPLQ9NP71 852 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 TRIM66O15016 1216 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRT86O43790 486 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FZD7O75084 574 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 COL8A1P27658 744 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GRNP28799 593 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NFATC2Q13469 925 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 KRT81Q14533 505 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SPDYCQ5MJ68 293 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 THSD4Q6ZMP0 1018 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF366Q8N895 744 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SORCS1Q8WY21 1168 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 CSRNP3Q8WYN3 585 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 ZNF524Q96C55 264 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 GPAMQ9HCL2 828 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 SCRT2Q9NQ03 307 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 NR2E1Q9Y466 385 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HRH3Q9Y5N1 445 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 HERC1Q15751 4861 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1277P-201ENST00000364561 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms