RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 ACSBG1Q96GR2 724 aa36.7■■■■□ 3.47
TPGS1-201ENST00000359315 SHANK3Q9BYB0 1731 aa36.69■■■■□ 3.46
TPGS1-201ENST00000359315 KCNQ2O43526 872 aa36.69■■■■□ 3.46
TPGS1-201ENST00000359315 CAMKK2Q96RR4 588 aa36.69■■■■□ 3.46
TPGS1-201ENST00000359315 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
TPGS1-201ENST00000359315 IGSF1Q8N6C5 1336 aa36.67■■■■□ 3.46
TPGS1-201ENST00000359315 SBF2Q86WG5 1849 aa36.67■■■■□ 3.46
TPGS1-201ENST00000359315 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
TPGS1-201ENST00000359315 IL13P35225 146 aa36.62■■■■□ 3.45
TPGS1-201ENST00000359315 AEBP1Q8IUX7 1158 aa36.6■■■■□ 3.45
TPGS1-201ENST00000359315 NHSQ6T4R5 1651 aa36.59■■■■□ 3.45
TPGS1-201ENST00000359315 CYP27B1O15528 508 aa36.57■■■■□ 3.44
TPGS1-201ENST00000359315 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa36.57■■■■□ 3.44
TPGS1-201ENST00000359315 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa36.57■■■■□ 3.44
TPGS1-201ENST00000359315 PARD3Q8TEW0 1356 aa36.55■■■■□ 3.44
TPGS1-201ENST00000359315 PKD1L3Q7Z443 1732 aa36.55■■■■□ 3.44
TPGS1-201ENST00000359315 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
TPGS1-201ENST00000359315 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
TPGS1-201ENST00000359315 PLSCR1O15162 318 aa36.52■■■■□ 3.44
TPGS1-201ENST00000359315 RREB1Q92766 1687 aa36.51■■■■□ 3.44
TPGS1-201ENST00000359315 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
TPGS1-201ENST00000359315 SULT6B1Q6IMI4 303 aa36.5■■■■□ 3.43
TPGS1-201ENST00000359315 DOT1LQ8TEK3 1739 aa36.5■■■■□ 3.43
TPGS1-201ENST00000359315 PPP2R1AP30153 589 aa36.49■■■■□ 3.43
TPGS1-201ENST00000359315 PROM2Q8N271 834 aa36.49■■■■□ 3.43
TPGS1-201ENST00000359315 SPG7Q9UQ90 795 aa36.49■■■■□ 3.43
TPGS1-201ENST00000359315 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
TPGS1-201ENST00000359315 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
TPGS1-201ENST00000359315 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP36.47■■■■□ 3.43
TPGS1-201ENST00000359315 KDRP35968 1356 aa36.47■■■■□ 3.43
TPGS1-201ENST00000359315 NUP188Q5SRE5 1749 aa36.47■■■■□ 3.43
TPGS1-201ENST00000359315 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
TPGS1-201ENST00000359315 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
TPGS1-201ENST00000359315 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa36.45■■■■□ 3.43
TPGS1-201ENST00000359315 BTAF1O14981 1849 aa36.43■■■■□ 3.42
TPGS1-201ENST00000359315 HMOX1P09601 288 aa36.43■■■■□ 3.42
TPGS1-201ENST00000359315 PHKG2P15735 406 aa36.42■■■■□ 3.42
TPGS1-201ENST00000359315 TXNRD1Q16881 649 aa36.42■■■■□ 3.42
TPGS1-201ENST00000359315 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa36.41■■■■□ 3.42
TPGS1-201ENST00000359315 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa36.4■■■■□ 3.42
TPGS1-201ENST00000359315 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
TPGS1-201ENST00000359315 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
TPGS1-201ENST00000359315 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
TPGS1-201ENST00000359315 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
TPGS1-201ENST00000359315 IFNL2Q8IZJ0 200 aa36.37■■■■□ 3.41
TPGS1-201ENST00000359315 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
TPGS1-201ENST00000359315 CFAP53Q96M91 514 aa36.33■■■■□ 3.41
TPGS1-201ENST00000359315 AMOTQ4VCS5 1084 aa36.32■■■■□ 3.4
TPGS1-201ENST00000359315 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa36.32■■■■□ 3.4
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC4BQ9NT99 713 aa36.31■■■■□ 3.4
TPGS1-201ENST00000359315 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
TPGS1-201ENST00000359315 KCNQ4P56696 695 aa36.29■■■■□ 3.4
TPGS1-201ENST00000359315 NBPF14Q5TI25 921 aa36.29■■■■□ 3.4
TPGS1-201ENST00000359315 PIGBQ92521 554 aa36.28■■■■□ 3.4
TPGS1-201ENST00000359315 KAT6BQ8WYB5 2073 aa36.25■■■■□ 3.39
TPGS1-201ENST00000359315 PAPPAQ13219 1627 aa36.24■■■■□ 3.39
TPGS1-201ENST00000359315 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
TPGS1-201ENST00000359315 C1orf141Q5JVX7 400 aa36.22■■■■□ 3.39
TPGS1-201ENST00000359315 RALBP1Q15311 655 aa36.21■■■■□ 3.39
TPGS1-201ENST00000359315 PALLDQ8WX93 1383 aa36.21■■■■□ 3.39
TPGS1-201ENST00000359315 DCAF5Q96JK2 942 aa36.21■■■■□ 3.39
TPGS1-201ENST00000359315 TMOD3Q9NYL9 352 aa36.21■■■■□ 3.39
TPGS1-201ENST00000359315 RSPH6AQ9H0K4 717 aa36.2■■■■□ 3.39
TPGS1-201ENST00000359315 ITGB4P16144 1822 aa36.2■■■■□ 3.38
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
TPGS1-201ENST00000359315 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF827Q17R98 1081 aa36.19■■■■□ 3.38
TPGS1-201ENST00000359315 SLC27A3Q5K4L6 730 aa36.19■■■■□ 3.38
TPGS1-201ENST00000359315 LY75O60449 1722 aa36.18■■■■□ 3.38
TPGS1-201ENST00000359315 NUDCQ9Y266 331 aa36.18■■■■□ 3.38
TPGS1-201ENST00000359315 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
TPGS1-201ENST00000359315 PRKAR2BP31323 418 aa36.17■■■■□ 3.38
TPGS1-201ENST00000359315 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP36.17■■■■□ 3.38
TPGS1-201ENST00000359315 STK32BQ9NY57 414 aa36.17■■■■□ 3.38
TPGS1-201ENST00000359315 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
TPGS1-201ENST00000359315 SLC15A2Q16348 729 aa36.16■■■■□ 3.38
TPGS1-201ENST00000359315 AKAP4Q5JQC9 854 aa36.16■■■■□ 3.38
TPGS1-201ENST00000359315 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
TPGS1-201ENST00000359315 ASAP1Q9ULH1 1129 aa36.16■■■■□ 3.38
TPGS1-201ENST00000359315 ERVV-2B6SEH9 535 aa36.15■■■■□ 3.38
TPGS1-201ENST00000359315 PHACTR3Q96KR7 559 aa36.14■■■■□ 3.38
TPGS1-201ENST00000359315 LGR6Q9HBX8 967 aa36.12■■■■□ 3.37
TPGS1-201ENST00000359315 ATG3Q9NT62 314 aa36.12■■■■□ 3.37
TPGS1-201ENST00000359315 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
TPGS1-201ENST00000359315 AKT1S1Q96B36 256 aa36.11■■■■□ 3.37
TPGS1-201ENST00000359315 CABP4P57796 275 aa36.1■■■■□ 3.37
TPGS1-201ENST00000359315 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
TPGS1-201ENST00000359315 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
TPGS1-201ENST00000359315 RNMTO43148 476 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
TPGS1-201ENST00000359315 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa36.06■■■■□ 3.36
TPGS1-201ENST00000359315 FCHSD2O94868 740 aa36.05■■■■□ 3.36
TPGS1-201ENST00000359315 GAS2L2Q8NHY3 880 aa36.05■■■■□ 3.36
TPGS1-201ENST00000359315 CASZ1Q86V15 1759 aa36.04■■■■□ 3.36
TPGS1-201ENST00000359315 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa36.04■■■■□ 3.36
TPGS1-201ENST00000359315 SIK1P57059 783 aa36.04■■■■□ 3.36
TPGS1-201ENST00000359315 MAP3K5Q99683 1374 aa36.03■■■■□ 3.36
TPGS1-201ENST00000359315 MRC1P22897 1456 aa36.03■■■■□ 3.36
TPGS1-201ENST00000359315 LRP5O75197 1615 aa36.02■■■■□ 3.36
TPGS1-201ENST00000359315 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa36.02■■■■□ 3.36
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