RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.79■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.79■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 ZMYND15Q9H091 742 aa22.78■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 IFT57Q9NWB7 429 aa22.78■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 CHRNA2Q15822 529 aa22.78■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.77■■□□□ 1.24
PDE4D-204ENST00000358923 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.76■■□□□ 1.23
PDE4D-204ENST00000358923 IP6K1Q92551 441 aa22.75■■□□□ 1.23
PDE4D-204ENST00000358923 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.75■■□□□ 1.23
PDE4D-204ENST00000358923 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PDE4D-204ENST00000358923 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
PDE4D-204ENST00000358923 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PDE4D-204ENST00000358923 ARHGEF10O15013 1369 aa22.72■■□□□ 1.23
PDE4D-204ENST00000358923 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.72■■□□□ 1.23
PDE4D-204ENST00000358923 IL17REQ8NFR9 667 aa22.72■■□□□ 1.23
PDE4D-204ENST00000358923 LGR6Q9HBX8 967 aa22.72■■□□□ 1.23
PDE4D-204ENST00000358923 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.72■■□□□ 1.23
PDE4D-204ENST00000358923 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PDE4D-204ENST00000358923 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.71■■□□□ 1.23
PDE4D-204ENST00000358923 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
PDE4D-204ENST00000358923 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.71■■□□□ 1.23
PDE4D-204ENST00000358923 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.71■■□□□ 1.23
PDE4D-204ENST00000358923 MST1RQ04912 1400 aa22.7■■□□□ 1.23
PDE4D-204ENST00000358923 CHL1O00533 1208 aa22.7■■□□□ 1.22
PDE4D-204ENST00000358923 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.7■■□□□ 1.22
PDE4D-204ENST00000358923 KDRP35968 1356 aa22.7■■□□□ 1.22
PDE4D-204ENST00000358923 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.69■■□□□ 1.22
PDE4D-204ENST00000358923 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PDE4D-204ENST00000358923 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.68■■□□□ 1.22
PDE4D-204ENST00000358923 PDE4AP27815 886 aa22.68■■□□□ 1.22
PDE4D-204ENST00000358923 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.68■■□□□ 1.22
PDE4D-204ENST00000358923 NWD1Q149M9 1564 aa22.68■■□□□ 1.22
PDE4D-204ENST00000358923 LTN1O94822 1766 aa22.68■■□□□ 1.22
PDE4D-204ENST00000358923 NFAT5O94916 1531 aa22.67■■□□□ 1.22
PDE4D-204ENST00000358923 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.66■■□□□ 1.22
PDE4D-204ENST00000358923 BRINP3Q76B58 766 aa22.66■■□□□ 1.22
PDE4D-204ENST00000358923 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.66■■□□□ 1.22
PDE4D-204ENST00000358923 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PDE4D-204ENST00000358923 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.66■■□□□ 1.22
PDE4D-204ENST00000358923 CRB1P82279 1406 aa22.65■■□□□ 1.22
PDE4D-204ENST00000358923 G2E3Q7L622 706 aa22.65■■□□□ 1.22
PDE4D-204ENST00000358923 KCNQ3O43525 872 aa22.65■■□□□ 1.22
PDE4D-204ENST00000358923 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.64■■□□□ 1.22
PDE4D-204ENST00000358923 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.64■■□□□ 1.22
PDE4D-204ENST00000358923 MSH6P52701 1360 aa22.64■■□□□ 1.21
PDE4D-204ENST00000358923 F6X3S4 739 aa22.63■■□□□ 1.21
PDE4D-204ENST00000358923 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.63■■□□□ 1.21
PDE4D-204ENST00000358923 SLC4A2P04920 1241 aa22.62■■□□□ 1.21
PDE4D-204ENST00000358923 KIF16BQ96L93 1317 aa22.62■■□□□ 1.21
PDE4D-204ENST00000358923 SLAIN2Q9P270 581 aa22.62■■□□□ 1.21
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PDE4D-204ENST00000358923 STRCQ7RTU9 1775 aa22.61■■□□□ 1.21
PDE4D-204ENST00000358923 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF428Q96B54 188 aa22.61■■□□□ 1.21
PDE4D-204ENST00000358923 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.6■■□□□ 1.21
PDE4D-204ENST00000358923 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.59■■□□□ 1.21
PDE4D-204ENST00000358923 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.59■■□□□ 1.21
PDE4D-204ENST00000358923 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.58■■□□□ 1.21
PDE4D-204ENST00000358923 BACH2Q9BYV9 841 aa22.58■■□□□ 1.21
PDE4D-204ENST00000358923 USP19O94966 1318 aa22.58■■□□□ 1.21
PDE4D-204ENST00000358923 ANXA1P04083 346 aa22.58■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.58■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.57■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 MAP3K5Q99683 1374 aa22.57■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 NFKBIBQ15653 356 aa22.56■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 RGPD5Q99666 1765 aa22.55■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 KIAA0232Q92628 1395 aa22.55■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 ERBB3P21860 1342 aa22.55■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.55■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 PXDNQ92626 1479 aa22.55■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 RTL1A6NKG5 1358 aa22.54■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.53■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.52■■□□□ 1.2
PDE4D-204ENST00000358923 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.5■■□□□ 1.19
PDE4D-204ENST00000358923 SLC39A6Q13433 755 aa22.5■■□□□ 1.19
PDE4D-204ENST00000358923 C8orf34Q49A92 452 aa22.5■■□□□ 1.19
PDE4D-204ENST00000358923 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PDE4D-204ENST00000358923 APBB1O00213 710 aa22.5■■□□□ 1.19
PDE4D-204ENST00000358923 SEC24BO95487 1268 aa22.5■■□□□ 1.19
PDE4D-204ENST00000358923 MS4A1P11836 297 aa22.49■■□□□ 1.19
PDE4D-204ENST00000358923 TEFQ10587 303 aa22.49■■□□□ 1.19
PDE4D-204ENST00000358923 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.49■■□□□ 1.19
PDE4D-204ENST00000358923 STRN4Q9NRL3 753 aa22.49■■□□□ 1.19
PDE4D-204ENST00000358923 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PDE4D-204ENST00000358923 LNPKQ9C0E8 428 aa22.48■■□□□ 1.19
PDE4D-204ENST00000358923 ABCC4O15439 1325 aa22.48■■□□□ 1.19
PDE4D-204ENST00000358923 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.48■■□□□ 1.19
PDE4D-204ENST00000358923 MEIS3Q99687 375 aa22.48■■□□□ 1.19
PDE4D-204ENST00000358923 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.48■■□□□ 1.19
PDE4D-204ENST00000358923 SLIT3O75094 1523 aa22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms