RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 PIK3R4Q99570 1358 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP1-201ENST00000357436 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SH3BP1-201ENST00000357436 USP31Q70CQ4 1352 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP1-201ENST00000357436 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP1-201ENST00000357436 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SH3BP1-201ENST00000357436 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.58■■□□□ 1.36
SH3BP1-201ENST00000357436 HOXC9P31274 260 aa23.58■■□□□ 1.36
SH3BP1-201ENST00000357436 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP1-201ENST00000357436 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP1-201ENST00000357436 PIK3C2AO00443 1686 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP1-201ENST00000357436 CFAP44Q96MT7 982 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP1-201ENST00000357436 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SH3BP1-201ENST00000357436 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SH3BP1-201ENST00000357436 FLT4P35916 1363 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP1-201ENST00000357436 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP1-201ENST00000357436 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BP1-201ENST00000357436 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCC4O15439 1325 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP1-201ENST00000357436 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BP1-201ENST00000357436 LNPKQ9C0E8 428 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP1-201ENST00000357436 SBNO1A3KN83 1393 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP1-201ENST00000357436 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP1-201ENST00000357436 NECTIN2Q92692 538 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP1-201ENST00000357436 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP1-201ENST00000357436 GCC1Q96CN9 775 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP1-201ENST00000357436 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
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SH3BP1-201ENST00000357436 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1-201ENST00000357436 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP1-201ENST00000357436 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP1-201ENST00000357436 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP1-201ENST00000357436 NBPF4Q96M43 638 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP1-201ENST00000357436 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP1-201ENST00000357436 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP1-201ENST00000357436 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP1-201ENST00000357436 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM94Q12767 1356 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1-201ENST00000357436 GCP02774 474 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1-201ENST00000357436 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP1-201ENST00000357436 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP1-201ENST00000357436 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP1-201ENST00000357436 CHL1O00533 1208 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP1-201ENST00000357436 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP1-201ENST00000357436 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGEF10O15013 1369 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP1-201ENST00000357436 ATF3P18847 181 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP1-201ENST00000357436 IL17REQ8NFR9 667 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 HSCBQ8IWL3 235 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 IP6K1Q92551 441 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 SNX21Q969T3 373 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 G2E3Q7L622 706 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 LGR6Q9HBX8 967 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 KDRP35968 1356 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA0232Q92628 1395 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 RGS12O14924 1447 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 F6X3S4 739 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC4A2P04920 1241 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 CHRNA2Q15822 529 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 CRB1P82279 1406 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 MCM4P33991 863 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 DCTPP1Q9H773 170 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 KIF2CQ99661 725 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 DDIT3P35638 169 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.31■■□□□ 1.32
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SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1-201ENST00000357436 NWD1Q149M9 1564 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1-201ENST00000357436 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1-201ENST00000357436 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPRCP08575 1304 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP1-201ENST00000357436 MSH6P52701 1360 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP1-201ENST00000357436 APBB1O00213 710 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP1-201ENST00000357436 LTN1O94822 1766 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP1-201ENST00000357436 CDC45O75419 566 aa23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1-201ENST00000357436 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
SH3BP1-201ENST00000357436 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
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