RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 TTC22Q5TAA0 569 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 TNRQ92752 1358 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 ARXQ96QS3 562 aa22.63■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 MSH6P52701 1360 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 USP6P35125 1406 aa22.61■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.6■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 RTL1A6NKG5 1358 aa22.59■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 USP31Q70CQ4 1352 aa22.59■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 RABEP1Q15276 862 aa22.59■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 CEP85Q6P2H3 762 aa22.59■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 ACEP12821 1306 aa22.59■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 PANK2Q9BZ23 570 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 CRB1P82279 1406 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS3-201ENST00000355530 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.58■■□□□ 1.2
SPNS3-201ENST00000355530 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGEF10O15013 1369 aa22.58■■□□□ 1.2
SPNS3-201ENST00000355530 KRT24Q2M2I5 525 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS3-201ENST00000355530 MCM10Q7L590 875 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS3-201ENST00000355530 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS3-201ENST00000355530 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SPNS3-201ENST00000355530 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS3-201ENST00000355530 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS3-201ENST00000355530 CASC1Q6TDU7 716 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS3-201ENST00000355530 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS3-201ENST00000355530 SSH2Q76I76 1423 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS3-201ENST00000355530 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS3-201ENST00000355530 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS3-201ENST00000355530 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS3-201ENST00000355530 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SPNS3-201ENST00000355530 MEIS3Q99687 375 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS3-201ENST00000355530 USP26Q9BXU7 913 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS3-201ENST00000355530 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SPNS3-201ENST00000355530 HMMRO75330 724 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 SDSP20132 328 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 SSFA2P28290 1259 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC37A3O60309 1634 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 SLC4A2P04920 1241 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 FLT4P35916 1363 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 KDRP35968 1356 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 SBNO1A3KN83 1393 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 REC8O95072 547 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 NUCB2P80303 420 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SPNS3-201ENST00000355530 ST18O60284 1047 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 CLCN1P35523 988 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 AK9Q5TCS8 1911 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 NUTM2FA1L443 756 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 APBB1O00213 710 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 PTPRUQ92729 1446 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 PIK3C2AO00443 1686 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 ERC2O15083 957 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 DIP2AQ14689 1571 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 SOX12O15370 315 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 LTKP29376 864 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 CACNA1FO60840 1977 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 FOXO3O43524 673 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 G2E3Q7L622 706 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 GNAI2P04899 355 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 STK31Q9BXU1 1019 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 PDE1AP54750 535 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 F6X3S4 739 aa22.39■■□□□ 1.18
SPNS3-201ENST00000355530 SLIT1O75093 1534 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS3-201ENST00000355530 USP54Q70EL1 1684 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS3-201ENST00000355530 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS3-201ENST00000355530 AMPHP49418 695 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
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