RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GDE1-201ENST00000353258 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
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GDE1-201ENST00000353258 LTKP29376 864 aa20.52■□□□□ 0.87
GDE1-201ENST00000353258 TSPYL6Q8N831 410 aa20.52■□□□□ 0.87
GDE1-201ENST00000353258 FAM83GA6ND36 823 aa20.51■□□□□ 0.87
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GDE1-201ENST00000353258 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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GDE1-201ENST00000353258 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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GDE1-201ENST00000353258 ST18O60284 1047 aa20.46■□□□□ 0.87
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GDE1-201ENST00000353258 ACEP12821 1306 aa20.46■□□□□ 0.87
GDE1-201ENST00000353258 VAMP4O75379 141 aa20.46■□□□□ 0.87
GDE1-201ENST00000353258 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.46■□□□□ 0.87
GDE1-201ENST00000353258 MON2Q7Z3U7 1717 aa20.45■□□□□ 0.86
GDE1-201ENST00000353258 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
GDE1-201ENST00000353258 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
GDE1-201ENST00000353258 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.45■□□□□ 0.86
GDE1-201ENST00000353258 ITSN1Q15811 1721 aa20.44■□□□□ 0.86
GDE1-201ENST00000353258 KNDC1Q76NI1 1749 aa20.44■□□□□ 0.86
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