RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 USP19O94966 1318 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 ANKRD44Q8N8A2 993 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 SASS6Q6UVJ0 657 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 SPC24Q8NBT2 197 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 ANTXR1Q9H6X2 564 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 ATP10AO60312 1499 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 ZRANB1Q9UGI0 708 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 DCTPP1Q9H773 170 aa18.65■□□□□ 0.58
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PTPRU-201ENST00000345512 PTPRCP08575 1304 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 DDX58O95786 925 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 KRT24Q2M2I5 525 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 ABTB2Q8N961 1025 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 PKNOX2Q96KN3 472 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 TPM4P67936 248 aa18.64■□□□□ 0.58
PTPRU-201ENST00000345512 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP18.64■□□□□ 0.58
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PTPRU-201ENST00000345512 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
PTPRU-201ENST00000345512 SLC26A8Q96RN1 970 aa18.64■□□□□ 0.57
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PTPRU-201ENST00000345512 TMX3Q96JJ7 454 aa18.63■□□□□ 0.57
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PTPRU-201ENST00000345512 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
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PTPRU-201ENST00000345512 AEBP1Q8IUX7 1158 aa18.63■□□□□ 0.57
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PTPRU-201ENST00000345512 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa18.62■□□□□ 0.57
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PTPRU-201ENST00000345512 PDE1AP54750 535 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRU-201ENST00000345512 PSME1Q06323 249 aa18.61■□□□□ 0.57
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PTPRU-201ENST00000345512 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
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PTPRU-201ENST00000345512 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
PTPRU-201ENST00000345512 USP26Q9BXU7 913 aa18.6■□□□□ 0.57
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PTPRU-201ENST00000345512 CEP85Q6P2H3 762 aa18.59■□□□□ 0.57
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PTPRU-201ENST00000345512 STK3Q13188 491 aa18.58■□□□□ 0.57
PTPRU-201ENST00000345512 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa18.58■□□□□ 0.57
PTPRU-201ENST00000345512 PDCL3Q9H2J4 239 aa18.58■□□□□ 0.57
PTPRU-201ENST00000345512 KRT85P78386 507 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC83Q8IWF9 413 aa18.58■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa18.58■□□□□ 0.56
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PTPRU-201ENST00000345512 FERMT3Q86UX7 667 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 KIF1BPQ96EK5 621 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 ATP7AQ04656 1500 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 SIL1Q9H173 461 aa18.57■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC183Q5T5S1 534 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 AACSQ86V21 672 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 ERC1Q8IUD2 1116 aa18.55■□□□□ 0.56
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PTPRU-201ENST00000345512 TTC5Q8N0Z6 440 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 FSD2A1L4K1 749 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 PLEKHF1Q96S99 279 aa18.55■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 SPG7Q9UQ90 795 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 TTC37Q6PGP7 1564 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 HIP1O00291 1037 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 GAS2L3Q86XJ1 694 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 NEUROD6Q96NK8 337 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 UGGT1Q9NYU2 1555 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 RAB11FIP3O75154 756 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.53■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
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