RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320238.3

NHLH2-201, Transcript of nescient helix-loop-helix 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLH2, Length 2,512 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2-201ENST00000320238 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
NHLH2-201ENST00000320238 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
NHLH2-201ENST00000320238 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.97■■□□□ 1.43
NHLH2-201ENST00000320238 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.97■■□□□ 1.43
NHLH2-201ENST00000320238 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.97■■□□□ 1.43
NHLH2-201ENST00000320238 MCM4P33991 863 aa23.97■■□□□ 1.43
NHLH2-201ENST00000320238 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
NHLH2-201ENST00000320238 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.97■■□□□ 1.43
NHLH2-201ENST00000320238 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
NHLH2-201ENST00000320238 ITSN1Q15811 1721 aa23.96■■□□□ 1.43
NHLH2-201ENST00000320238 MSH6P52701 1360 aa23.96■■□□□ 1.43
NHLH2-201ENST00000320238 EYA1Q99502 592 aa23.96■■□□□ 1.43
NHLH2-201ENST00000320238 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
NHLH2-201ENST00000320238 NLRP6P59044 892 aa23.95■■□□□ 1.42
NHLH2-201ENST00000320238 AKAP12Q02952 1782 aa23.95■■□□□ 1.42
NHLH2-201ENST00000320238 DCTPP1Q9H773 170 aa23.95■■□□□ 1.42
NHLH2-201ENST00000320238 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.94■■□□□ 1.42
NHLH2-201ENST00000320238 CEP85Q6P2H3 762 aa23.94■■□□□ 1.42
NHLH2-201ENST00000320238 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.94■■□□□ 1.42
NHLH2-201ENST00000320238 C14orf37Q86TY3 774 aa23.93■■□□□ 1.42
NHLH2-201ENST00000320238 RGS12O14924 1447 aa23.93■■□□□ 1.42
NHLH2-201ENST00000320238 PEAK1Q9H792 1746 aa23.93■■□□□ 1.42
NHLH2-201ENST00000320238 PLEKHG5O94827 1062 aa23.93■■□□□ 1.42
NHLH2-201ENST00000320238 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
NHLH2-201ENST00000320238 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.91■■□□□ 1.42
NHLH2-201ENST00000320238 CRB1P82279 1406 aa23.9■■□□□ 1.42
NHLH2-201ENST00000320238 USP31Q70CQ4 1352 aa23.9■■□□□ 1.42
NHLH2-201ENST00000320238 CDC45O75419 566 aa23.9■■□□□ 1.42
NHLH2-201ENST00000320238 KCNA6P17658 529 aa23.89■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 ATP10DQ9P241 1426 aa23.89■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 RTL1A6NKG5 1358 aa23.88■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.88■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 SSH2Q76I76 1423 aa23.88■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 TTC22Q5TAA0 569 aa23.87■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.87■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 FLT4P35916 1363 aa23.87■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 SNX21Q969T3 373 aa23.87■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 TRAK2O60296 914 aa23.86■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.86■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 KIAA0232Q92628 1395 aa23.86■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 TBX22Q9Y458 520 aa23.86■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.85■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 PTPRCP08575 1304 aa23.85■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 ABTB2Q8N961 1025 aa23.85■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.85■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 SBNO1A3KN83 1393 aa23.85■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 SDSP20132 328 aa23.83■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 ARHGEF10O15013 1369 aa23.83■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 DDIT3P35638 169 aa23.83■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.83■■□□□ 1.41
NHLH2-201ENST00000320238 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.82■■□□□ 1.4
NHLH2-201ENST00000320238 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.82■■□□□ 1.4
NHLH2-201ENST00000320238 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
NHLH2-201ENST00000320238 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.81■■□□□ 1.4
NHLH2-201ENST00000320238 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
NHLH2-201ENST00000320238 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
NHLH2-201ENST00000320238 HOXC9P31274 260 aa23.81■■□□□ 1.4
NHLH2-201ENST00000320238 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.8■■□□□ 1.4
NHLH2-201ENST00000320238 STK31Q9BXU1 1019 aa23.8■■□□□ 1.4
NHLH2-201ENST00000320238 IL17REQ8NFR9 667 aa23.79■■□□□ 1.4
NHLH2-201ENST00000320238 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.79■■□□□ 1.4
NHLH2-201ENST00000320238 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.78■■□□□ 1.4
NHLH2-201ENST00000320238 PANK2Q9BZ23 570 aa23.78■■□□□ 1.4
NHLH2-201ENST00000320238 FLIIQ13045 1269 aa23.78■■□□□ 1.4
NHLH2-201ENST00000320238 KDRP35968 1356 aa23.77■■□□□ 1.4
NHLH2-201ENST00000320238 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.77■■□□□ 1.4
NHLH2-201ENST00000320238 USP26Q9BXU7 913 aa23.76■■□□□ 1.39
NHLH2-201ENST00000320238 DIP2AQ14689 1571 aa23.76■■□□□ 1.39
NHLH2-201ENST00000320238 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
NHLH2-201ENST00000320238 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
NHLH2-201ENST00000320238 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.75■■□□□ 1.39
NHLH2-201ENST00000320238 SSFA2P28290 1259 aa23.75■■□□□ 1.39
NHLH2-201ENST00000320238 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.75■■□□□ 1.39
NHLH2-201ENST00000320238 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
NHLH2-201ENST00000320238 HMMRO75330 724 aa23.74■■□□□ 1.39
NHLH2-201ENST00000320238 GNAI2P04899 355 aa23.74■■□□□ 1.39
NHLH2-201ENST00000320238 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.74■■□□□ 1.39
NHLH2-201ENST00000320238 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.73■■□□□ 1.39
NHLH2-201ENST00000320238 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.73■■□□□ 1.39
NHLH2-201ENST00000320238 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
NHLH2-201ENST00000320238 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.72■■□□□ 1.39
NHLH2-201ENST00000320238 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
NHLH2-201ENST00000320238 PDE1AP54750 535 aa23.71■■□□□ 1.39
NHLH2-201ENST00000320238 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.71■■□□□ 1.39
NHLH2-201ENST00000320238 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
NHLH2-201ENST00000320238 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
NHLH2-201ENST00000320238 CASC1Q6TDU7 716 aa23.7■■□□□ 1.38
NHLH2-201ENST00000320238 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.7■■□□□ 1.38
NHLH2-201ENST00000320238 PIK3C2AO00443 1686 aa23.7■■□□□ 1.38
NHLH2-201ENST00000320238 GBP4Q96PP9 640 aa23.69■■□□□ 1.38
NHLH2-201ENST00000320238 SLIT1O75093 1534 aa23.68■■□□□ 1.38
NHLH2-201ENST00000320238 PKP1Q13835 747 aa23.68■■□□□ 1.38
NHLH2-201ENST00000320238 RABEP1Q15276 862 aa23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms