RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 HSCBQ8IWL3 235 aa24.43■■□□□ 1.5
SPNS1-201ENST00000311008 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.43■■□□□ 1.5
SPNS1-201ENST00000311008 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
SPNS1-201ENST00000311008 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
SPNS1-201ENST00000311008 DCTPP1Q9H773 170 aa24.42■■□□□ 1.5
SPNS1-201ENST00000311008 SNX21Q969T3 373 aa24.41■■□□□ 1.5
SPNS1-201ENST00000311008 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.41■■□□□ 1.5
SPNS1-201ENST00000311008 RGS12O14924 1447 aa24.4■■□□□ 1.5
SPNS1-201ENST00000311008 AMPHP49418 695 aa24.4■■□□□ 1.5
SPNS1-201ENST00000311008 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.4■■□□□ 1.5
SPNS1-201ENST00000311008 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SPNS1-201ENST00000311008 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.39■■□□□ 1.5
SPNS1-201ENST00000311008 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.39■■□□□ 1.5
SPNS1-201ENST00000311008 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.39■■□□□ 1.5
SPNS1-201ENST00000311008 SOX12O15370 315 aa24.37■■□□□ 1.49
SPNS1-201ENST00000311008 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SPNS1-201ENST00000311008 KRT24Q2M2I5 525 aa24.36■■□□□ 1.49
SPNS1-201ENST00000311008 PIK3C2AO00443 1686 aa24.35■■□□□ 1.49
SPNS1-201ENST00000311008 ATP10DQ9P241 1426 aa24.35■■□□□ 1.49
SPNS1-201ENST00000311008 CDC45O75419 566 aa24.35■■□□□ 1.49
SPNS1-201ENST00000311008 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.35■■□□□ 1.49
SPNS1-201ENST00000311008 EYA1Q99502 592 aa24.35■■□□□ 1.49
SPNS1-201ENST00000311008 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.35■■□□□ 1.49
SPNS1-201ENST00000311008 SLC4A2P04920 1241 aa24.33■■□□□ 1.49
SPNS1-201ENST00000311008 RTL1A6NKG5 1358 aa24.33■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 NLRP6P59044 892 aa24.33■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 CEP85Q6P2H3 762 aa24.33■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.33■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.32■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 USP54Q70EL1 1684 aa24.32■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 MSH6P52701 1360 aa24.32■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 FOXO3O43524 673 aa24.3■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 HMMRO75330 724 aa24.3■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.3■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 TTC22Q5TAA0 569 aa24.29■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa24.29■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 KCNA6P17658 529 aa24.28■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 HOXC9P31274 260 aa24.28■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 MCM4P33991 863 aa24.28■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.27■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 STK31Q9BXU1 1019 aa24.27■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.27■■□□□ 1.48
SPNS1-201ENST00000311008 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
SPNS1-201ENST00000311008 MEIS3Q99687 375 aa24.26■■□□□ 1.47
SPNS1-201ENST00000311008 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.26■■□□□ 1.47
SPNS1-201ENST00000311008 LRRC37A3O60309 1634 aa24.26■■□□□ 1.47
SPNS1-201ENST00000311008 KIF2CQ99661 725 aa24.26■■□□□ 1.47
SPNS1-201ENST00000311008 DDIT3P35638 169 aa24.25■■□□□ 1.47
SPNS1-201ENST00000311008 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.25■■□□□ 1.47
SPNS1-201ENST00000311008 ABTB2Q8N961 1025 aa24.24■■□□□ 1.47
SPNS1-201ENST00000311008 CASC1Q6TDU7 716 aa24.23■■□□□ 1.47
SPNS1-201ENST00000311008 MAP3K5Q99683 1374 aa24.22■■□□□ 1.47
SPNS1-201ENST00000311008 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SPNS1-201ENST00000311008 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
SPNS1-201ENST00000311008 DDX11L8A8MPP1 907 aa24.21■■□□□ 1.47
SPNS1-201ENST00000311008 NWD1Q149M9 1564 aa24.21■■□□□ 1.47
SPNS1-201ENST00000311008 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
SPNS1-201ENST00000311008 GNAI2P04899 355 aa24.2■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 G2E3Q7L622 706 aa24.2■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.19■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 GNAI3P08754 354 aa24.19■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 IL27Q8NEV9 243 aa24.19■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.19■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 RABEP1Q15276 862 aa24.18■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 FLIIQ13045 1269 aa24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.17■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.16■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 CACNA1FO60840 1977 aa24.16■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 F6X3S4 739 aa24.16■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.16■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.16■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 PTMSP20962 102 aa24.15■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 IL17REQ8NFR9 667 aa24.15■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.15■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 SDSP20132 328 aa24.15■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 IP6K1Q92551 441 aa24.14■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 USP26Q9BXU7 913 aa24.14■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
SPNS1-201ENST00000311008 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.14■■□□□ 1.45
SPNS1-201ENST00000311008 GBP4Q96PP9 640 aa24.14■■□□□ 1.45
SPNS1-201ENST00000311008 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-201ENST00000311008 TRAK2O60296 914 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-201ENST00000311008 REC8O95072 547 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-201ENST00000311008 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-201ENST00000311008 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SPNS1-201ENST00000311008 C14orf37Q86TY3 774 aa24.11■■□□□ 1.45
SPNS1-201ENST00000311008 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.11■■□□□ 1.45
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