RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 USP31Q70CQ4 1352 aa25.15■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.14■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 FAM83GA6ND36 823 aa25.14■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.14■■□□□ 1.62
HPS6-201ENST00000299238 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
HPS6-201ENST00000299238 NUCB1Q02818 461 aa25.14■■□□□ 1.61
HPS6-201ENST00000299238 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.14■■□□□ 1.61
HPS6-201ENST00000299238 CFAP44Q96MT7 982 aa25.14■■□□□ 1.61
HPS6-201ENST00000299238 PDE4CQ08493 712 aa25.12■■□□□ 1.61
HPS6-201ENST00000299238 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.12■■□□□ 1.61
HPS6-201ENST00000299238 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.12■■□□□ 1.61
HPS6-201ENST00000299238 TRAK2O60296 914 aa25.12■■□□□ 1.61
HPS6-201ENST00000299238 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
HPS6-201ENST00000299238 LNPKQ9C0E8 428 aa25.12■■□□□ 1.61
HPS6-201ENST00000299238 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
HPS6-201ENST00000299238 DCTN1Q14203 1278 aa25.11■■□□□ 1.61
HPS6-201ENST00000299238 ARID3AQ99856 593 aa25.11■■□□□ 1.61
HPS6-201ENST00000299238 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
HPS6-201ENST00000299238 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
HPS6-201ENST00000299238 C22orf23Q9BZE7 217 aa25.1■■□□□ 1.61
HPS6-201ENST00000299238 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.09■■□□□ 1.61
HPS6-201ENST00000299238 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.09■■□□□ 1.61
HPS6-201ENST00000299238 ABCC4O15439 1325 aa25.08■■□□□ 1.61
HPS6-201ENST00000299238 PIK3C2AO00443 1686 aa25.08■■□□□ 1.61
HPS6-201ENST00000299238 SOX12O15370 315 aa25.08■■□□□ 1.61
HPS6-201ENST00000299238 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.08■■□□□ 1.61
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HPS6-201ENST00000299238 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
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HPS6-201ENST00000299238 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
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HPS6-201ENST00000299238 SBNO1A3KN83 1393 aa25.01■■□□□ 1.59
HPS6-201ENST00000299238 FLT4P35916 1363 aa25.01■■□□□ 1.59
HPS6-201ENST00000299238 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.01■■□□□ 1.59
HPS6-201ENST00000299238 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.01■■□□□ 1.59
HPS6-201ENST00000299238 GCC1Q96CN9 775 aa25.01■■□□□ 1.59
HPS6-201ENST00000299238 GAS2L3Q86XJ1 694 aa25■■□□□ 1.59
HPS6-201ENST00000299238 KCNA6P17658 529 aa24.99■■□□□ 1.59
HPS6-201ENST00000299238 ANKRD45Q5TZF3 282 aa24.99■■□□□ 1.59
HPS6-201ENST00000299238 MCM10Q7L590 875 aa24.99■■□□□ 1.59
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HPS6-201ENST00000299238 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.95■■□□□ 1.58
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HPS6-201ENST00000299238 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
HPS6-201ENST00000299238 FOXO3O43524 673 aa24.9■■□□□ 1.58
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HPS6-201ENST00000299238 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
HPS6-201ENST00000299238 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
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HPS6-201ENST00000299238 EYA1Q99502 592 aa24.89■■□□□ 1.58
HPS6-201ENST00000299238 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.88■■□□□ 1.57
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HPS6-201ENST00000299238 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.87■■□□□ 1.57
HPS6-201ENST00000299238 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.87■■□□□ 1.57
HPS6-201ENST00000299238 LRRC37A3O60309 1634 aa24.87■■□□□ 1.57
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HPS6-201ENST00000299238 SNX21Q969T3 373 aa24.85■■□□□ 1.57
HPS6-201ENST00000299238 ATP10DQ9P241 1426 aa24.85■■□□□ 1.57
HPS6-201ENST00000299238 NWD1Q149M9 1564 aa24.85■■□□□ 1.57
HPS6-201ENST00000299238 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.85■■□□□ 1.57
HPS6-201ENST00000299238 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.84■■□□□ 1.57
HPS6-201ENST00000299238 KIF2CQ99661 725 aa24.84■■□□□ 1.57
HPS6-201ENST00000299238 HOXC9P31274 260 aa24.84■■□□□ 1.57
HPS6-201ENST00000299238 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.84■■□□□ 1.57
HPS6-201ENST00000299238 DCTPP1Q9H773 170 aa24.84■■□□□ 1.57
HPS6-201ENST00000299238 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.84■■□□□ 1.57
HPS6-201ENST00000299238 MAP7D2Q96T17 732 aa24.83■■□□□ 1.57
HPS6-201ENST00000299238 LTN1O94822 1766 aa24.83■■□□□ 1.57
HPS6-201ENST00000299238 ABTB2Q8N961 1025 aa24.83■■□□□ 1.57
HPS6-201ENST00000299238 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.82■■□□□ 1.56
HPS6-201ENST00000299238 PTPRCP08575 1304 aa24.82■■□□□ 1.56
HPS6-201ENST00000299238 DDIT3P35638 169 aa24.82■■□□□ 1.56
HPS6-201ENST00000299238 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
HPS6-201ENST00000299238 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
HPS6-201ENST00000299238 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.82■■□□□ 1.56
HPS6-201ENST00000299238 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.82■■□□□ 1.56
HPS6-201ENST00000299238 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
HPS6-201ENST00000299238 MSH6P52701 1360 aa24.81■■□□□ 1.56
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