RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293778.10

CXCL16-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 16, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL16, Length 2,222 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL16-201ENST00000293778 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
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CXCL16-201ENST00000293778 USP54Q70EL1 1684 aa25.14■■□□□ 1.62
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CXCL16-201ENST00000293778 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.12■■□□□ 1.61
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CXCL16-201ENST00000293778 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.1■■□□□ 1.61
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CXCL16-201ENST00000293778 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.98■■□□□ 1.59
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CXCL16-201ENST00000293778 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.9■■□□□ 1.58
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CXCL16-201ENST00000293778 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.88■■□□□ 1.57
CXCL16-201ENST00000293778 NBPF4Q96M43 638 aa24.88■■□□□ 1.57
CXCL16-201ENST00000293778 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.88■■□□□ 1.57
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CXCL16-201ENST00000293778 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
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CXCL16-201ENST00000293778 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
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CXCL16-201ENST00000293778 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.8■■□□□ 1.56
CXCL16-201ENST00000293778 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CXCL16-201ENST00000293778 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.79■■□□□ 1.56
CXCL16-201ENST00000293778 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CXCL16-201ENST00000293778 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.79■■□□□ 1.56
CXCL16-201ENST00000293778 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
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