RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
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UBE2Q1-201ENST00000292211 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.37■■□□□ 1.81
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.37■■□□□ 1.81
UBE2Q1-201ENST00000292211 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.35■■□□□ 1.81
UBE2Q1-201ENST00000292211 HOXC9P31274 260 aa26.35■■□□□ 1.81
UBE2Q1-201ENST00000292211 PEAK1Q9H792 1746 aa26.34■■□□□ 1.81
UBE2Q1-201ENST00000292211 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.34■■□□□ 1.81
UBE2Q1-201ENST00000292211 SEC24BO95487 1268 aa26.34■■□□□ 1.81
UBE2Q1-201ENST00000292211 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.34■■□□□ 1.81
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UBE2Q1-201ENST00000292211 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.31■■□□□ 1.8
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UBE2Q1-201ENST00000292211 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.27■■□□□ 1.8
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UBE2Q1-201ENST00000292211 PIK3C2AO00443 1686 aa26.26■■□□□ 1.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
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UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.24■■□□□ 1.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.23■■□□□ 1.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 ABCC4O15439 1325 aa26.23■■□□□ 1.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.21■■□□□ 1.79
UBE2Q1-201ENST00000292211 PDE4CQ08493 712 aa26.2■■□□□ 1.78
UBE2Q1-201ENST00000292211 CHD1LQ86WJ1 897 aa26.2■■□□□ 1.78
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UBE2Q1-201ENST00000292211 IL17REQ8NFR9 667 aa26.14■■□□□ 1.77
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UBE2Q1-201ENST00000292211 MAP3K5Q99683 1374 aa26.11■■□□□ 1.77
UBE2Q1-201ENST00000292211 FGD1P98174 961 aa26.1■■□□□ 1.77
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UBE2Q1-201ENST00000292211 RRP9O43818 475 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
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UBE2Q1-201ENST00000292211 BECN1Q14457 450 aa26.09■■□□□ 1.77
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UBE2Q1-201ENST00000292211 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
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UBE2Q1-201ENST00000292211 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.07■■□□□ 1.76
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
UBE2Q1-201ENST00000292211 TBC1D32Q96NH3 1257 aa26.05■■□□□ 1.76
UBE2Q1-201ENST00000292211 LGR6Q9HBX8 967 aa26.05■■□□□ 1.76
UBE2Q1-201ENST00000292211 RTL1A6NKG5 1358 aa26.05■■□□□ 1.76
UBE2Q1-201ENST00000292211 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.05■■□□□ 1.76
UBE2Q1-201ENST00000292211 TEFQ10587 303 aa26.04■■□□□ 1.76
UBE2Q1-201ENST00000292211 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.04■■□□□ 1.76
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
UBE2Q1-201ENST00000292211 FLIIQ13045 1269 aa26.03■■□□□ 1.76
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