RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 PDLIM2Q96JY6 352 aa27.09■■□□□ 1.93
PITX1-201ENST00000265340 ADGRB2O60241 1585 aa27.09■■□□□ 1.93
PITX1-201ENST00000265340 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
PITX1-201ENST00000265340 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
PITX1-201ENST00000265340 CBX1P83916 185 aa27.08■■□□□ 1.93
PITX1-201ENST00000265340 TMEM94Q12767 1356 aa27.08■■□□□ 1.93
PITX1-201ENST00000265340 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27.08■■□□□ 1.93
PITX1-201ENST00000265340 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
PITX1-201ENST00000265340 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
PITX1-201ENST00000265340 MYRIPQ8NFW9 859 aa27.06■■□□□ 1.92
PITX1-201ENST00000265340 POLKQ9UBT6 870 aa27.06■■□□□ 1.92
PITX1-201ENST00000265340 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.06■■□□□ 1.92
PITX1-201ENST00000265340 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.05■■□□□ 1.92
PITX1-201ENST00000265340 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.05■■□□□ 1.92
PITX1-201ENST00000265340 HSCBQ8IWL3 235 aa27.04■■□□□ 1.92
PITX1-201ENST00000265340 AKAP12Q02952 1782 aa27.03■■□□□ 1.92
PITX1-201ENST00000265340 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
PITX1-201ENST00000265340 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
PITX1-201ENST00000265340 BCAR3O75815 825 aa27.02■■□□□ 1.92
PITX1-201ENST00000265340 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.92
PITX1-201ENST00000265340 RAB3GAP1Q15042 981 aa27.01■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 CCDC27Q2M243 656 aa27.01■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.01■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 ITSN1Q15811 1721 aa27■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 TEX2Q8IWB9 1127 aa27■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 ZNF710Q8N1W2 664 aa27■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 SLC20A2Q08357 652 aa26.99■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 KLHL34Q8N239 644 aa26.99■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.99■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 RBM25P49756 843 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 ATP2B3Q16720 1220 aa26.99■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 WDR63Q8IWG1 891 aa26.99■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.913e-8■■■□□ 18.7
PITX1-201ENST00000265340 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa26.98■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 ZNF445P59923 1031 aa26.98■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 SMC5Q8IY18 1101 aa26.98■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.98■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 KLHL40Q2TBA0 621 aa26.97■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 ACEP12821 1306 aa26.96■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.96■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 PRIMPOLQ96LW4 560 aa26.96■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.95■■□□□ 1.91
PITX1-201ENST00000265340 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.95■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 COG3Q96JB2 828 aa26.94■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 CCDC39Q9UFE4 941 aa26.94■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.93■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.93■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 ATF3P18847 181 aa26.92■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 SNX21Q969T3 373 aa26.92■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.92■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 PDE3AQ14432 1141 aa26.91■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.91■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.91■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.91■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 ZBTB22O15209 634 aa26.91■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 ORAI2Q96SN7 254 aa26.9■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA6L22H0YM25 854 aa26.9■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 CLEC17AQ6ZS10 378 aa26.89■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PITX1-201ENST00000265340 MSH6P52701 1360 aa26.89■■□□□ 1.89
PITX1-201ENST00000265340 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.89■■□□□ 1.89
PITX1-201ENST00000265340 USP6P35125 1406 aa26.88■■□□□ 1.89
PITX1-201ENST00000265340 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
PITX1-201ENST00000265340 FCHSD2O94868 740 aa26.87■■□□□ 1.89
PITX1-201ENST00000265340 IL13P35225 146 aa26.87■■□□□ 1.89
PITX1-201ENST00000265340 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PITX1-201ENST00000265340 HMOX1P09601 288 aa26.87■■□□□ 1.89
PITX1-201ENST00000265340 PRKAR2BP31323 418 aa26.86■■□□□ 1.89
PITX1-201ENST00000265340 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PITX1-201ENST00000265340 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PITX1-201ENST00000265340 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PITX1-201ENST00000265340 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.85■■□□□ 1.89
PITX1-201ENST00000265340 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
PITX1-201ENST00000265340 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.84■■□□□ 1.89
PITX1-201ENST00000265340 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.84■■□□□ 1.89
PITX1-201ENST00000265340 SSH2Q76I76 1423 aa26.83■■□□□ 1.89
PITX1-201ENST00000265340 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.83■■□□□ 1.89
PITX1-201ENST00000265340 RBSNQ9H1K0 784 aa26.83■■□□□ 1.89
PITX1-201ENST00000265340 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.83■■□□□ 1.89
PITX1-201ENST00000265340 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.83■■□□□ 1.89
PITX1-201ENST00000265340 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.82■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.82■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 MST1RQ04912 1400 aa26.81■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.81■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 FOXO3O43524 673 aa26.8■■□□□ 1.88
PITX1-201ENST00000265340 RGS22Q8NE09 1264 aa26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms