RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253008.2

PRDM12-201, Transcript of PR/SET domain 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM12, Length 2,476 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12-201ENST00000253008 MSH6P52701 1360 aa22.75■■□□□ 1.23
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PRDM12-201ENST00000253008 G2E3Q7L622 706 aa22.74■■□□□ 1.23
PRDM12-201ENST00000253008 ATP10DQ9P241 1426 aa22.74■■□□□ 1.23
PRDM12-201ENST00000253008 F6X3S4 739 aa22.73■■□□□ 1.23
PRDM12-201ENST00000253008 CEP85Q6P2H3 762 aa22.73■■□□□ 1.23
PRDM12-201ENST00000253008 FSD2A1L4K1 749 aa22.73■■□□□ 1.23
PRDM12-201ENST00000253008 CDC45O75419 566 aa22.73■■□□□ 1.23
PRDM12-201ENST00000253008 SLC4A2P04920 1241 aa22.73■■□□□ 1.23
PRDM12-201ENST00000253008 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
PRDM12-201ENST00000253008 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.73■■□□□ 1.23
PRDM12-201ENST00000253008 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.73■■□□□ 1.23
PRDM12-201ENST00000253008 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.73■■□□□ 1.23
PRDM12-201ENST00000253008 ITSN1Q15811 1721 aa22.73■■□□□ 1.23
PRDM12-201ENST00000253008 PEAK1Q9H792 1746 aa22.72■■□□□ 1.23
PRDM12-201ENST00000253008 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.72■■□□□ 1.23
PRDM12-201ENST00000253008 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.72■■□□□ 1.23
PRDM12-201ENST00000253008 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.72■■□□□ 1.23
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PRDM12-201ENST00000253008 TTC22Q5TAA0 569 aa22.71■■□□□ 1.23
PRDM12-201ENST00000253008 USP6P35125 1406 aa22.71■■□□□ 1.23
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PRDM12-201ENST00000253008 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.7■■□□□ 1.22
PRDM12-201ENST00000253008 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PRDM12-201ENST00000253008 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.7■■□□□ 1.22
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PRDM12-201ENST00000253008 CRB1P82279 1406 aa22.69■■□□□ 1.22
PRDM12-201ENST00000253008 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.68■■□□□ 1.22
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PRDM12-201ENST00000253008 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.67■■□□□ 1.22
PRDM12-201ENST00000253008 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.67■■□□□ 1.22
PRDM12-201ENST00000253008 NECTIN2Q92692 538 aa22.67■■□□□ 1.22
PRDM12-201ENST00000253008 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.66■■□□□ 1.22
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PRDM12-201ENST00000253008 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.65■■□□□ 1.22
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PRDM12-201ENST00000253008 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.65■■□□□ 1.22
PRDM12-201ENST00000253008 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.65■■□□□ 1.22
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PRDM12-201ENST00000253008 EYA1Q99502 592 aa22.64■■□□□ 1.21
PRDM12-201ENST00000253008 USP26Q9BXU7 913 aa22.64■■□□□ 1.21
PRDM12-201ENST00000253008 KIAA0232Q92628 1395 aa22.64■■□□□ 1.21
PRDM12-201ENST00000253008 USP31Q70CQ4 1352 aa22.63■■□□□ 1.21
PRDM12-201ENST00000253008 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.63■■□□□ 1.21
PRDM12-201ENST00000253008 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
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PRDM12-201ENST00000253008 SSH2Q76I76 1423 aa22.61■■□□□ 1.21
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PRDM12-201ENST00000253008 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
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PRDM12-201ENST00000253008 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.59■■□□□ 1.21
PRDM12-201ENST00000253008 GBP4Q96PP9 640 aa22.58■■□□□ 1.21
PRDM12-201ENST00000253008 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.57■■□□□ 1.2
PRDM12-201ENST00000253008 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PRDM12-201ENST00000253008 ARHGEF10O15013 1369 aa22.57■■□□□ 1.2
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PRDM12-201ENST00000253008 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PRDM12-201ENST00000253008 NLRP6P59044 892 aa22.55■■□□□ 1.2
PRDM12-201ENST00000253008 FLT4P35916 1363 aa22.55■■□□□ 1.2
PRDM12-201ENST00000253008 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.55■■□□□ 1.2
PRDM12-201ENST00000253008 RABEP1Q15276 862 aa22.54■■□□□ 1.2
PRDM12-201ENST00000253008 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.54■■□□□ 1.2
PRDM12-201ENST00000253008 MRE11P49959 708 aa22.54■■□□□ 1.2
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PRDM12-201ENST00000253008 SBNO1A3KN83 1393 aa22.54■■□□□ 1.2
PRDM12-201ENST00000253008 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.54■■□□□ 1.2
PRDM12-201ENST00000253008 PDE1AP54750 535 aa22.53■■□□□ 1.2
PRDM12-201ENST00000253008 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.53■■□□□ 1.2
PRDM12-201ENST00000253008 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.53■■□□□ 1.2
PRDM12-201ENST00000253008 EID1Q9Y6B2 187 aa22.53■■□□□ 1.2
PRDM12-201ENST00000253008 KDRP35968 1356 aa22.52■■□□□ 1.2
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PRDM12-201ENST00000253008 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
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PRDM12-201ENST00000253008 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PRDM12-201ENST00000253008 STK31Q9BXU1 1019 aa22.49■■□□□ 1.19
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PRDM12-201ENST00000253008 HMMRO75330 724 aa22.49■■□□□ 1.19
PRDM12-201ENST00000253008 HOXC9P31274 260 aa22.48■■□□□ 1.19
PRDM12-201ENST00000253008 MCTP1Q6DN14 999 aa22.48■■□□□ 1.19
PRDM12-201ENST00000253008 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.47■■□□□ 1.19
PRDM12-201ENST00000253008 ERC2O15083 957 aa22.47■■□□□ 1.19
PRDM12-201ENST00000253008 CASC1Q6TDU7 716 aa22.47■■□□□ 1.19
PRDM12-201ENST00000253008 KCNA6P17658 529 aa22.46■■□□□ 1.19
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