RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000159111.8

KDM4B-201, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KDM4B, Length 5,593 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-201ENST00000159111 AK7Q96M32 723 aa20.24■□□□□ 0.83
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KDM4B-201ENST00000159111 TDO2P48775 406 aa20.14■□□□□ 0.82
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KDM4B-201ENST00000159111 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
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KDM4B-201ENST00000159111 MYO6Q9UM54 1294 aa20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 ODF2Q5BJF6 829 aa20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.13■□□□□ 0.81
KDM4B-201ENST00000159111 NUP62CLQ9H1M0 184 aa20.13■□□□□ 0.81
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KDM4B-201ENST00000159111 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.12■□□□□ 0.81
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KDM4B-201ENST00000159111 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
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