RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF428Q96B54 188 aa23.8■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.8■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.8■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.79■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.79■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.79■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.79■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 NBPF4Q96M43 638 aa23.79■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 USP19O94966 1318 aa23.79■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.79■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 MS4A1P11836 297 aa23.78■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.78■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 ALS2Q96Q42 1657 aa23.78■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
SIKE1-201ENST00000060969 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.76■■□□□ 1.39
SIKE1-201ENST00000060969 MSH6P52701 1360 aa23.75■■□□□ 1.39
SIKE1-201ENST00000060969 AAMPQ13685 434 aa23.75■■□□□ 1.39
SIKE1-201ENST00000060969 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
SIKE1-201ENST00000060969 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SIKE1-201ENST00000060969 RGS3P49796 1198 aa23.74■■□□□ 1.39
SIKE1-201ENST00000060969 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.74■■□□□ 1.39
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
SIKE1-201ENST00000060969 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.73■■□□□ 1.39
SIKE1-201ENST00000060969 PDE4AP27815 886 aa23.73■■□□□ 1.39
SIKE1-201ENST00000060969 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.73■■□□□ 1.39
SIKE1-201ENST00000060969 LRRC37A3O60309 1634 aa23.72■■□□□ 1.39
SIKE1-201ENST00000060969 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.72■■□□□ 1.39
SIKE1-201ENST00000060969 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SIKE1-201ENST00000060969 MAP3K5Q99683 1374 aa23.71■■□□□ 1.39
SIKE1-201ENST00000060969 IL17REQ8NFR9 667 aa23.71■■□□□ 1.39
SIKE1-201ENST00000060969 KIAA0232Q92628 1395 aa23.7■■□□□ 1.38
SIKE1-201ENST00000060969 RGPD5Q99666 1765 aa23.7■■□□□ 1.38
SIKE1-201ENST00000060969 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.69■■□□□ 1.38
SIKE1-201ENST00000060969 BACH2Q9BYV9 841 aa23.69■■□□□ 1.38
SIKE1-201ENST00000060969 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.69■■□□□ 1.38
SIKE1-201ENST00000060969 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SIKE1-201ENST00000060969 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.68■■□□□ 1.38
SIKE1-201ENST00000060969 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.68■■□□□ 1.38
SIKE1-201ENST00000060969 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.68■■□□□ 1.38
SIKE1-201ENST00000060969 PXDNQ92626 1479 aa23.67■■□□□ 1.38
SIKE1-201ENST00000060969 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SIKE1-201ENST00000060969 ABCC4O15439 1325 aa23.65■■□□□ 1.38
SIKE1-201ENST00000060969 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.65■■□□□ 1.38
SIKE1-201ENST00000060969 BRINP3Q76B58 766 aa23.65■■□□□ 1.38
SIKE1-201ENST00000060969 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
SIKE1-201ENST00000060969 NCAPD2Q15021 1401 aa23.63■■□□□ 1.37
SIKE1-201ENST00000060969 ERBB3P21860 1342 aa23.61■■□□□ 1.37
SIKE1-201ENST00000060969 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.61■■□□□ 1.37
SIKE1-201ENST00000060969 LGR6Q9HBX8 967 aa23.61■■□□□ 1.37
SIKE1-201ENST00000060969 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.61■■□□□ 1.37
SIKE1-201ENST00000060969 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SIKE1-201ENST00000060969 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SIKE1-201ENST00000060969 RGS12O14924 1447 aa23.6■■□□□ 1.37
SIKE1-201ENST00000060969 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SIKE1-201ENST00000060969 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.6■■□□□ 1.37
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SIKE1-201ENST00000060969 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.59■■□□□ 1.37
SIKE1-201ENST00000060969 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.59■■□□□ 1.37
SIKE1-201ENST00000060969 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SIKE1-201ENST00000060969 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.58■■□□□ 1.37
SIKE1-201ENST00000060969 SLC4A2P04920 1241 aa23.58■■□□□ 1.37
SIKE1-201ENST00000060969 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SIKE1-201ENST00000060969 CHRNA2Q15822 529 aa23.58■■□□□ 1.37
SIKE1-201ENST00000060969 SLAIN2Q9P270 581 aa23.58■■□□□ 1.36
SIKE1-201ENST00000060969 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.57■■□□□ 1.36
SIKE1-201ENST00000060969 COL18A1P39060 1754 aa23.57■■□□□ 1.36
SIKE1-201ENST00000060969 C8orf34Q49A92 452 aa23.57■■□□□ 1.36
SIKE1-201ENST00000060969 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SIKE1-201ENST00000060969 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.56■■□□□ 1.36
SIKE1-201ENST00000060969 G2E3Q7L622 706 aa23.56■■□□□ 1.36
SIKE1-201ENST00000060969 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SIKE1-201ENST00000060969 NECTIN2Q92692 538 aa23.55■■□□□ 1.36
SIKE1-201ENST00000060969 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.55■■□□□ 1.36
SIKE1-201ENST00000060969 FAM161AQ3B820 660 aa23.54■■□□□ 1.36
SIKE1-201ENST00000060969 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.54■■□□□ 1.36
SIKE1-201ENST00000060969 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.54■■□□□ 1.36
SIKE1-201ENST00000060969 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SIKE1-201ENST00000060969 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SIKE1-201ENST00000060969 PTPRCP08575 1304 aa23.52■■□□□ 1.36
SIKE1-201ENST00000060969 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SIKE1-201ENST00000060969 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.51■■□□□ 1.35
SIKE1-201ENST00000060969 KCNQ3O43525 872 aa23.51■■□□□ 1.35
SIKE1-201ENST00000060969 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.51■■□□□ 1.35
SIKE1-201ENST00000060969 SMC5Q8IY18 1101 aa23.5■■□□□ 1.35
SIKE1-201ENST00000060969 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-201ENST00000060969 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-201ENST00000060969 F6X3S4 739 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-201ENST00000060969 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-201ENST00000060969 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-201ENST00000060969 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-201ENST00000060969 TEFQ10587 303 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-201ENST00000060969 NBR1Q14596 966 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-201ENST00000060969 STK31Q9BXU1 1019 aa23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms