RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628742.2

SOX9-AS1-218, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 733 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NOP2P46087 812 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TPI1P60174 286 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DNASE1L3Q13609 305 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DPYSL2Q16555 572 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CA9Q16790 459 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NADK2Q4G0N4 442 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LRRC66Q68CR7 880 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RFLNAQ6ZTI6 216 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TMEM26Q6ZUK4 368 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 USP45Q70EL2 814 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SYVN1Q86TM6 617 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TMEM135Q86UB9 458 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LRRC49Q8IUZ0 686 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FAM114A1Q8IWE2 563 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CARFQ8N187 725 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 EXD1Q8NHP7 514 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FAM71BQ8TC56 605 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 AP2M1Q96CW1 435 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PEBP4Q96S96 227 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 AGAP2Q99490 1192 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 C11orf70Q9BRQ4 267 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CARD9Q9H257 536 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ACTL8Q9H568 366 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ADAM22Q9P0K1 906 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 AMACRQ9UHK6 382 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DNPEPQ9ULA0 475 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PADI1Q9ULC6 663 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PCSK5Q92824 1860 aa6.66□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TTLL8A6PVC2 850 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 BIN1O00499 593 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 EPHB6O15197 1021 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CREB3O43889 395 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DNAJB5O75953 348 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 KRT38O76015 456 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NDUFA10O95299 355 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TIAF1O95411 115 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CAPN1P07384 714 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PDHA1P08559 390 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 BRAFP15056 766 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CES1P23141 567 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PTPN4P29074 926 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NSFP46459 744 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SCNN1BP51168 640 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PGDP52209 483 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GFERP55789 205 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SOX8P57073 446 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DCDC1P59894 354 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MAMLD1Q13495 774 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 IL10RAQ13651 578 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ERV3-1Q14264 604 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CHRNA6Q15825 494 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ERMARDQ5T6L9 678 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SLC6A19Q695T7 634 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PDPK2PQ6A1A2 396 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RAET1GQ6H3X3 334 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CYB5D1Q6P9G0 228 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TREML4Q6UXN2 200 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SLC9B2Q86UD5 537 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 KMT5CQ86Y97 462 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DTX3LQ8TDB6 740 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CT55Q8WUE5 264 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NCSTNQ92542 709 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MAML1Q92585 1016 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SCAMP4Q969E2 229 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PDCL3Q9H2J4 239 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SLC40A1Q9NP59 571 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 POT1Q9NUX5 634 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 C5AR2Q9P296 337 aa6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SOX9-AS1-218ENST00000628742 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms