RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKCQQ04759 706 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 GPRC6AQ5T6X5 926 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF687Q8N1G0 1237 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM151AQ8N4L1 468 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 CHMP6Q96FZ7 201 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS35Q96QK1 796 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR21Q99679 349 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC6A17Q9H1V8 727 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 GALPQ9UBC7 116 aa24.66■■□□□ 1.54
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CAPNS1-215ENST00000628018 CA14Q9ULX7 337 aa24.66■■□□□ 1.54
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
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CAPNS1-215ENST00000628018 CLDN19Q8N6F1 224 aa24.65■■□□□ 1.54
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CAPNS1-215ENST00000628018 SYTL2Q9HCH5 934 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXL12Q9NXK8 326 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-215ENST00000628018 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
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CAPNS1-215ENST00000628018 BTN2A2Q8WVV5 523 aa24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 MECRQ9BV79 373 aa24.64■■□□□ 1.53
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CAPNS1-215ENST00000628018 COPG2Q9UBF2 871 aa24.64■■□□□ 1.53
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CAPNS1-215ENST00000628018 E5RI56 91 aa24.63■■□□□ 1.53
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CAPNS1-215ENST00000628018 ALDH3A1P30838 453 aa24.61■■□□□ 1.53
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CAPNS1-215ENST00000628018 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
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CAPNS1-215ENST00000628018 GANCQ8TET4 914 aa24.61■■□□□ 1.53
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CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
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CAPNS1-215ENST00000628018 KCTD5Q9NXV2 234 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 XPR1Q9UBH6 696 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 MID2Q9UJV3 735 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-215ENST00000628018 KRBA1A5PL33 1030 aa24.61■■□□□ 1.53
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