RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 LRRK2Q5S007 2527 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 GPR89AB7ZAQ6 455 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 C9P02748 559 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 GPR89BP0CG08 455 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 OAS2P29728 719 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 ZBTB17Q13105 803 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF569Q5MCW4 686 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 GPR26Q8NDV2 337 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 RAPGEF5Q92565 580 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 C9orf72Q96LT7 481 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 RNF157Q96PX1 679 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 CHUKO15111 745 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 KDELR1P24390 212 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 STAT5AP42229 794 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 GFERP55789 205 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 UBASH3AP57075 661 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 DCDC1P59894 354 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 MC1RQ01726 317 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 MAP7Q14244 749 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 ESX1Q8N693 406 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 STARD8Q92502 1023 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 SLC23A2Q9UGH3 650 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 ANAPC2Q9UJX6 822 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRF-216ENST00000617451 GYPCP04921 128 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 CASRP41180 1078 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 DEFB109BQ30KR1 87 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 ALS2CLQ60I27 953 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 PDPK2PQ6A1A2 396 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM26Q6ZUK4 368 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 TMC3Q7Z5M5 1100 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 TRAM1L1Q8N609 369 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 PLD5Q8N7P1 536 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 GLYATL1Q969I3 302 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 CBX8Q9HC52 389 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEE1Q9HCI5 957 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 LCMT1Q9UIC8 334 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 SHOC2Q9UQ13 582 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 MTA2O94776 668 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 UBXN7O94888 489 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 VIPP01282 170 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 H2AFZP0C0S5 128 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 PIRTP0C851 137 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 TYRP1P17643 537 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 TCN2P20062 427 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 SLC19A1P41440 591 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 NOP2P46087 812 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 FAM182AQ5T1J6 154 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 CRTC3Q6UUV7 619 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 H2AFVQ71UI9 128 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 LUZP1Q86V48 1076 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 RAD18Q9NS91 495 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 HEY1Q9Y5J3 304 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 PRR19A6NJB7 356 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF487B1APH4 448 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 KMOO15229 486 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 TPM4P67936 248 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 FOXM1Q08050 763 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 INSCQ1MX18 579 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 NT5DC3Q86UY8 548 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM48Q8IWZ4 208 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 ABHD17AQ96GS6 310 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 PACSIN1Q9BY11 444 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 CEP41Q9BYV8 373 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 ULBP3Q9BZM4 244 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 BRD8Q9H0E9 1235 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF28P17035 718 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 F8A1P23610 371 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 FOXK1P85037 733 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 AP1B1Q10567 949 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 C16orf46Q6P387 395 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 LRRTM4Q86VH4 590 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 TADA1Q96BN2 335 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRF-216ENST00000617451 AGAP3Q96P47 875 aa24.54■■□□□ 1.52
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