RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599560.5

NUP62-216, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 2

Gene NUP62, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-216	ENST00000599560	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	MME	P08473	750 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	STS	P08842	583 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	SDC4	P31431	198 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	PTS	Q03393	145 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	ART3	Q13508	389 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	GPR19	Q15760	415 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	LRRC66	Q68CR7	880 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	MED25	Q71SY5	747 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	STRADA	Q7RTN6	431 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	NPW	Q8N729	165 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	UCK1	Q9HA47	277 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	FGF21	Q9NSA1	209 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	FZD10	Q9ULW2	581 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		11.91	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	C19orf84	I3L1E1	186 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	PSMD11	O00231	422 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	PDHA1	P08559	390 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	BRAF	P15056	766 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	HTR1E	P28566	365 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	FOXL2	P58012	376 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	AP1S1	P61966	158 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	GPR18	Q14330	331 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	NXPE1	Q8N323	547 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	SCRN2	Q96FV2	425 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	MAP3K3	Q99759	626 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	NOD2	Q9HC29	1040 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	DTL	Q9NZJ0	730 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		11.9	□□□□□ -0.5
NUP62-216	ENST00000599560	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	SCRG1	O75711	98 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	LCA5L	O95447	670 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	VIP	P01282	170 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	COX6B1	P14854	86 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	BPI	P17213	487 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	IHH	Q14623	411 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	CDSN	Q15517	529 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	HIF1A	Q16665	826 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	CA9	Q16790	459 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	GBP6	Q6ZN66	633 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	CDH24	Q86UP0	819 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	LZTR1	Q8N653	840 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	SMARCE1	Q969G3	411 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	PPM1M	Q96MI6	270 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	PSKH2	Q96QS6	385 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	KLC4	Q9NSK0	619 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	VPS18	Q9P253	973 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	OR5K4	A6NMS3	321 aa		11.88	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	DFFA	O00273	331 aa		11.88	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	CCP110	O43303	1012 aa		11.88	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	GRID2	O43424	1007 aa		11.88	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	PGLS	O95336	258 aa		11.88	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	PEX11B	O96011	259 aa		11.88	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		11.88	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	RORA	P35398	523 aa		11.88	□□□□□ -0.51
NUP62-216	ENST00000599560	KCNK10	P57789	538 aa		11.88	□□□□□ -0.51

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms