RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 SP100P23497 879 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ST8SIA6P61647 398 aa28.18■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-210ENST00000574322 C1SP09871 688 aa28.18■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-210ENST00000574322 IL2P60568 153 aa28.18■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-210ENST00000574322 UPK3BL2E5RIL1 263 aa28.16■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-210ENST00000574322 HERVK_113P63132 956 aa28.16■■■□□ 2.1
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CTDNEP1-210ENST00000574322 RAD18Q9NS91 495 aa28.14■■■□□ 2.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa28.14■■■□□ 2.1
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