RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC50Q8IVM0 306 aa7.09□□□□□ -1.27
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CCNDBP1-212ENST00000567690 IL22RA1Q8N6P7 574 aa7.09□□□□□ -1.27
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CCNDBP1-212ENST00000567690 OR4D9Q8NGE8 314 aa7.09□□□□□ -1.27
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CCNDBP1-212ENST00000567690 OR52A4PA6NMU1 304 aa7.07□□□□□ -1.28
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CCNDBP1-212ENST00000567690 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CDK14O94921 469 aa7.07□□□□□ -1.28
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CD82P27701 267 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDKN2BP42772 138 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 SEPHS1P49903 392 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 WNT3AP56704 352 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 DCDC1P59894 354 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 FOXM1Q08050 763 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 WASHC5Q12768 1159 aa7.07□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 TFDP2Q14188 446 aa7.07□□□□□ -1.28
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