RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563295.1

KIFC3-215, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 5

Gene KIFC3, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-215	ENST00000563295	LRRC45	Q96CN5	670 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	VPS35	Q96QK1	796 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	FICD	Q9BVA6	458 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	IL26	Q9NPH9	171 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	IL17C	Q9P0M4	197 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	ATRX	P46100	2492 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295		A0A0G2JNG1	304 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	OR5K4	A6NMS3	321 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	C2orf81	A6NN90	581 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	KMO	O15229	486 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	PPM1D	O15297	605 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	CDK14	O94921	469 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	ITGA2B	P08514	1039 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	ITPKB	P27987	946 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	PSMB4	P28070	264 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	CD1C	P29017	333 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	SPAM1	P38567	509 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	FASLG	P48023	281 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	SQSTM1	Q13501	440 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	KIR2DS5	Q14953	304 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	IYD	Q6PHW0	289 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	USP53	Q70EK8	1073 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	AVL9	Q8NBF6	648 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	GDAP1	Q8TB36	358 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	TTC25	Q96NG3	672 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	RDH14	Q9HBH5	336 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	KLC4	Q9NSK0	619 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	KCNK6	Q9Y257	313 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295		A6NCN8	305 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	SNX2	O60749	519 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	EML2	O95834	649 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	CCDC175	P0C221	793 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	JMJD7	P0C870	316 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	F3	P13726	295 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	VCL	P18206	1134 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	UGT1A5	P35504	534 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	GPLD1	P80108	840 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	PDE1B	Q01064	536 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	HHEX	Q03014	270 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	ITGA9	Q13797	1035 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	GTF2H3	Q13889	308 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	CHRNA6	Q15825	494 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	INSC	Q1MX18	579 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	PARP6	Q2NL67	630 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	PHF19	Q5T6S3	580 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	CLEC14A	Q86T13	490 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	PDZD3	Q86UT5	571 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	OR10G6	Q8NH81	332 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-215	ENST00000563295	SLC38A3	Q99624	504 aa		9.81	□□□□□ -0.84

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