RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 BCAP31P51572 246 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 CCR4P51679 360 aa8.44□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 H3BNX3 289 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 PEX11AO75192 247 aa8.44□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 TM7SF2O76062 418 aa8.43□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 TAS2R50P59544 299 aa8.43□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 LRIG1Q96JA1 1093 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 BPIFA1Q9NP55 256 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 PEAK1Q9H792 1746 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC162PA2VCL2 907 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 GPR25O00155 361 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 CDK14O94921 469 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 CTPS1P17812 591 aa8.43□□□□□ -1.06
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