RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 SIRPB2Q5JXA9 342 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRJ-206ENST00000534219 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
PTPRJ-206ENST00000534219 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
PTPRJ-206ENST00000534219 ZFAND4Q86XD8 727 aa24.65■■□□□ 1.54
PTPRJ-206ENST00000534219 SH3KBP1Q96B97 665 aa24.65■■□□□ 1.54
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PTPRJ-206ENST00000534219 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
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PTPRJ-206ENST00000534219 FOXJ2Q9P0K8 574 aa24.65■■□□□ 1.54
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PTPRJ-206ENST00000534219 C9orf172C9J069 976 aa24.64■■□□□ 1.54
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PTPRJ-206ENST00000534219 MTX2O75431 263 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRJ-206ENST00000534219 GPR89BP0CG08 455 aa24.64■■□□□ 1.54
PTPRJ-206ENST00000534219 F3P13726 295 aa24.64■■□□□ 1.54
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PTPRJ-206ENST00000534219 TMEM71Q6P5X7 295 aa24.64■■□□□ 1.54
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PTPRJ-206ENST00000534219 IPMKQ8NFU5 416 aa24.64■■□□□ 1.54
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PTPRJ-206ENST00000534219 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
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PTPRJ-206ENST00000534219 A0A0G2JNG1 304 aa24.63■■□□□ 1.53
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PTPRJ-206ENST00000534219 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa24.63■■□□□ 1.53
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PTPRJ-206ENST00000534219 EPOP01588 193 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-206ENST00000534219 APOC2P02655 101 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-206ENST00000534219 THRAP10827 490 aa24.63■■□□□ 1.53
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PTPRJ-206ENST00000534219 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa24.63■■□□□ 1.53
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PTPRJ-206ENST00000534219 HACD3Q9P035 362 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRJ-206ENST00000534219 UNC13CQ8NB66 2214 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRJ-206ENST00000534219 A8MU76 341 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRJ-206ENST00000534219 EFSO43281 561 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRJ-206ENST00000534219 CD82P27701 267 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRJ-206ENST00000534219 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PTPRJ-206ENST00000534219 GTF2H3Q13889 308 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRJ-206ENST00000534219 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
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