RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513331.1

GFM2-208, Transcript of G elongation factor mitochondrial 2, human

TSL 2

Gene GFM2, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GFM2-208	ENST00000513331	PSMA3	P25788	255 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	TSPAN7	P41732	249 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	GABRB2	P47870	512 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	MXI1	P50539	228 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	PTP4A2	Q12974	167 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	WLS	Q5T9L3	541 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	SAAL1	Q96ER3	474 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	MED30	Q96HR3	178 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	CABS1	Q96KC9	395 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	MEIS3	Q99687	375 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	CDK19	Q9BWU1	502 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	TRIM7	Q9C029	511 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	PEAK1	Q9H792	1746 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	PREB	Q9HCU5	417 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	SARDH	Q9UL12	918 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GFM2-208	ENST00000513331	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ATP7B	P35670	1465 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CRB1	P82279	1406 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	PDLIM1	O00151	329 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	AHCYL1	O43865	530 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CD58	P19256	250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	GCK	P35557	465 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TXNDC8	Q6A555	127 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	SHF	Q7M4L6	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	MFN1	Q8IWA4	741 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	FBXL8	Q96CD0	374 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	BICD1	Q96G01	975 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	PPM1M	Q96MI6	270 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	LRFN5	Q96NI6	719 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ABCA3	Q99758	1704 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	USP6	P35125	1406 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	LINC01553	A4QN01	128 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TAF4	O00268	1085 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	WNT9B	O14905	357 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TIMM23	O14925	209 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	SLC28A2	O43868	658 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	KLK8	O60259	260 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ERLIN1	O75477	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CH25H	O95992	272 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TF	P02787	698 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	FCGR1A	P12314	374 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	ETFA	P13804	333 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	EDN2	P20800	178 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	EFNA5	P52803	228 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GFM2-208	ENST00000513331	PARP10	Q53GL7	1025 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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